结论：三方签字的协议是可以补办公证的，但具体能否补办成功及补办的流程，需根据协议内容、各方意愿及公证处的具体要求来确定。

分析说明：

1. 公证的基本概念与作用：

   • 公证是公证机构根据自然人、法人或者其他组织的申请，依照法定程序对民事法律行为、有法律意义的事实和文书的真实性、合法性予以证明的活动。
   • 公证可以增强协议的法律效力，为协议的履行提供更有力的保障，特别是在涉及大额财产、重要权益或需要第三方见证的情况下，公证显得尤为重要。

2. 三方签字协议补办公证的可能性：

   • 既然协议已经由三方签字，说明协议在形式上已经成立。只要协议内容不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，且各方均同意补办公证，那么理论上是可以补办公证的。
   • 公证处会对协议的真实性、合法性进行审查，如果协议内容存在争议或违法之处，公证处可能会拒绝公证。

3. 补办公证的具体流程：

   • 准备材料：各方需准备身份证明、协议原件及复印件等相关材料。
   • 提交申请：向当地公证处提交公证申请，并填写相关表格。
   • 审查与核实：公证处会对提交的材料进行审查，并可能要求各方到场核实身份、确认协议内容等。
   • 出具公证书：如果审查通过，公证处会出具公证书，对协议的真实性、合法性予以证明。

4. 特殊情况下的考虑：

   • 如果协议中的某一方因故无法到场或无法提供有效身份证明，可能会影响公证的进行。此时，需要与公证处沟通，看是否能通过其他方式（如委托公证、视频公证等）进行补救。
   • 如果协议内容涉及复杂法律关系或需要专业评估（如房产价值评估、股权评估等），可能需要先完成相关评估或鉴定，再提交公证处进行公证。

法律建议：

• 在补办公证前，建议各方先对协议内容进行仔细审查，确保协议内容无争议、无违法之处。
• 如果对协议内容或公证流程有疑问，可以提前咨询公证处或专业律师，以避免不必要的麻烦和损失。
• 补办公证时，务必按照公证处的要求准备材料、填写表格，并积极配合公证处的审查与核实工作。

后续行动指南：

• 如果您决定补办公证，可以先联系当地公证处，了解具体的公证要求和流程。
• 在准备材料时，务必确保材料的真实性和完整性，以免因材料问题导致公证失败。
• 如果在补办公证过程中遇到任何问题或困难，可以随时向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议和帮助。