若对刑事案件办理程序存在异议，可通过以下途径依法主张权利：

1. 向办案机关提出书面异议
   根据《刑事诉讼法》第117条，当事人对侦查、审查起诉、审判等环节的程序性事项有异议时，可向公安机关、检察院或法院提出书面申请，要求说明理由或纠正违法行为。例如：

   • 若认为超期羁押，可申请解除强制措施；
     
   • 若认为证据收集违法，可申请非法证据排除。
     操作要点：需明确异议事项、法律依据及诉求，并附相关证据材料。

2. 申请检察机关法律监督
   根据《人民检察院刑事诉讼规则》第551条，当事人认为公安机关、法院的程序违法侵害其权益时，可向同级或上级检察院申请立案监督、侦查活动监督或审判活动监督。例如：

   • 检察院可向公安机关发出《纠正违法通知书》；
     
   • 对法院程序违法可提出检察建议或抗诉。
     注意：需在知道违法事实后7日内提出，并提供初步证据。

3. 通过审判阶段程序救济

   • 一审阶段：可在庭审中提出程序异议（如回避申请、管辖权异议），法院需依法作出裁定或决定。
     
   • 二审阶段：若一审程序违法（如未依法开庭、剥夺辩护权），可依据《刑事诉讼法》第238条以“程序违法”为由提起上诉，二审法院应撤销原判、发回重审。
     
   • 再审阶段：若判决已生效，可依据《刑事诉讼法》第253条以“违反法定诉讼程序”为由申请再审。

4. 投诉与信访渠道补充
   若办案机关未依法处理，可向其上级机关或同级政法委投诉，但需注意：

   • 投诉不替代法定救济程序，需同步通过法律途径主张权利；
     
   • 信访材料应聚焦程序违法事实，避免情绪化表述。

风险提示：程序异议需严格在法定时限内提出（如上诉期10日、抗诉期5日），逾期可能丧失救济权。建议根据异议类型选择最直接有效的途径，必要时委托律师协助准备法律文书及证据材料。