三个村之间对一块土地有争议且都没有证据时，仍可以提出确权申请，但能否确权成功需结合具体情况判断。以下从不同角度展开分析：

1. 确权申请的法律依据与程序
   根据《土地管理法》第十四条及《土地权属争议调查处理办法》，土地权属争议可由当事人协商解决；协商不成的，由人民政府处理。即使没有直接证据，争议各方仍有权向乡镇政府或县级自然资源部门提出确权申请，相关部门会依法启动调查程序，包括实地勘查、询问当事人、查阅历史资料等，最终作出处理决定。

2. 无证据时的确权可能性

   • 间接证据与历史痕迹：若争议土地存在长期使用痕迹（如耕作、建房）、历史管理记录（如税费缴纳凭证、村集体会议记录）或相邻地块的权属证明，可作为间接证据辅助确权。
     
   • 公平原则与历史形成：若争议因历史原因（如行政区划调整、土地改革时期分配）导致权属模糊，政府可能依据“尊重历史、面对现实”原则，结合公平性裁决。例如，若某村长期实际管理该土地且无相反证据，可能被认定为权属人。
     
   • 举证责任分配：根据《行政诉讼法》第三十四条，被告（政府）对作出的行政行为负有举证责任。若政府调查后仍无法查清事实，可能以“证据不足”为由不予确权，但争议各方仍可通过诉讼途径主张权利。

3. 实务建议

   • 积极收集证据：即使无直接权属证明，也可尝试收集土地使用记录（如照片、视频）、证人证言（如老村民、相邻村负责人）、历史文件（如旧地图、分田记录）等。
     
   • 申请政府调查：向乡镇政府或县级自然资源部门提交书面申请，明确争议范围、事实理由及诉求，要求启动调查程序。
     
   • 协商或调解：在申请确权前，可尝试通过村委会、乡镇司法所等渠道协商，达成书面协议后申请确权登记。
     
   • 法律救济途径：若对政府处理决定不服，可在收到决定之日起60日内申请行政复议，或6个月内提起行政诉讼。

总结：无证据并非确权申请的绝对障碍，但需通过政府调查、间接证据或历史痕迹争取支持。建议争议各方优先协商或申请调解，同时积极收集证据，必要时通过法律途径维护权益。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作流程。