超过再审期限再审立案后，主要会产生以下法律后果：
程序上的特殊性：
- 再审程序本身是对已经发生法律效力的判决、裁定、调解书进行再次审查的一种特殊程序。当案件超过再审期限但仍被立案再审时，这体现了司法机关对案件的审慎态度和对当事人合法权益的保障。然而，这也意味着该案件将经历更为复杂和严格的审查过程，因为再审程序通常比一审、二审程序更为严格，对证据的审查、事实的认定以及法律的适用都会更加细致。
可能面临驳回再审申请的风险：
- 根据《中华人民共和国民事诉讼法》及相关司法解释的规定，再审申请应当在法定期限内提出。如果超过法定期限，虽然理论上仍有可能被立案再审，但实践中，法院可能会以超过再审期限为由驳回再审申请。这是因为再审期限的设定是为了维护法律秩序的稳定性和判决的终局性。当然，如果存在特殊情况，如因不可抗力或其他正当理由导致未能及时提出再审申请，法院可能会酌情考虑。
对原判决、裁定、调解书效力的影响：
- 一旦案件被立案再审，无论是否超过再审期限，原判决、裁定、调解书的效力都会受到暂时性的影响。在再审期间，原判决、裁定、调解书通常不会被执行，以等待再审结果。如果再审结果维持原判，则原判决、裁定、调解书的效力得以恢复；如果再审结果改判或撤销原判，则原判决、裁定、调解书的效力将被否定，并产生新的法律效力。
对当事人权益的实质性影响：
- 对于当事人而言，超过再审期限再审立案可能意味着他们获得了又一次寻求司法公正的机会。然而，这也可能带来一定的不确定性和风险。如果再审结果不利，当事人可能需要承担更多的诉讼成本和时间成本。同时，如果原判决、裁定、调解书已经被执行，再审改判或撤销原判后，当事人还可能面临执行回转等复杂问题。
法律建议：
- 对于当事人而言，如果认为原判决、裁定、调解书存在错误，应尽可能在法定期限内提出再审申请，以避免超过再审期限带来的不利后果。
- 如果确实因特殊原因未能及时提出再审申请，应在申请时详细说明理由，并提供相关证据支持，以增加再审立案的可能性。
- 在再审过程中，当事人应积极配合法院的审查工作，提供充分的证据和理由支持自己的主张，以争取有利的再审结果。
总结：超过再审期限再审立案后，案件将经历更为复杂和严格的审查过程，可能面临驳回再审申请的风险，并对原判决、裁定、调解书的效力以及当事人权益产生实质性影响。因此，当事人在提出再审申请时应谨慎考虑，并在法定期限内提出以避免不利后果。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。