医师违反实名就诊制度，将面临行政处罚、医疗机构内部处分，情节严重构成犯罪的，还将承担刑事责任。具体分析如下：

1. 行政处罚：

   • 根据《中华人民共和国医师法》第五十六条，医师在执业活动中若存在“未按照规定履行告知义务或者取得知情同意”“拒不使用或者违规使用麻醉药品、医疗用毒性药品、精神药品、放射性药品”等行为，虽未直接提及“违反实名就诊”，但若违反实名就诊导致患者信息不实、影响诊疗安全或医保基金安全等，可能被认定为“严重不负责任”或“违反诊疗规范”，由县级以上人民政府卫生健康主管部门责令改正，给予警告，没收违法所得，并处一万元以上三万元以下的罚款；情节严重的，责令暂停六个月以上一年以下执业活动直至吊销医师执业证书。
   • 若违反实名就诊涉及伪造、变造、买卖、出租、出借医师执业证书等行为，根据《医师法》第五十四条，由县级以上人民政府卫生健康主管部门责令改正，没收违法所得，并处违法所得二倍以上五倍以下的罚款，违法所得不足一万元的，按一万元计算；情节严重的，吊销医师执业证书。

2. 医疗机构内部处分：

   • 医疗机构对医师违反实名就诊制度的行为，可依据内部规章制度（如《医疗机构从业人员行为规范》《医师考核管理办法》）给予警告、记过、降级、撤职、开除等处分。
   • 若违反实名就诊导致医疗事故或纠纷，医疗机构可能根据《医疗事故处理条例》追究医师责任，包括经济赔偿、行政处分等。

3. 刑事责任：

   • 若医师违反实名就诊制度，伪造、变造患者身份信息或诊疗记录，情节严重构成犯罪的（如诈骗罪、伪造国家机关公文证件罪等），将依法追究刑事责任。例如，若通过虚假就诊骗取医保基金，可能构成诈骗罪，根据《刑法》第二百六十六条，数额较大的处三年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处或者单处罚金；数额巨大或有其他严重情节的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金。

建议：医师应严格遵守实名就诊制度，确保患者信息真实、准确；医疗机构应加强内部管理，定期核查医师执业行为；患者若发现医师违反实名就诊，可向当地卫生健康主管部门举报。如有具体法律问题，可直接向我咨询。