结论：店主是否有罪，取决于其是否知道手机是捡来的以及是否参与了非法活动。如果店主在不知情的情况下刷机，一般不构成犯罪；但如果店主明知手机是捡来的且可能涉及非法所得，仍进行刷机等处理，则可能构成掩饰、隐瞒犯罪所得罪。
分析如下：
店主不知情的情况：
- 如果店主在刷机时并不知道手机是捡来的，也没有理由怀疑手机的来源非法，那么店主的行为通常不构成犯罪。因为店主没有主观上的故意，也没有实施任何违法行为。
店主知情的情况：
- 如果店主明知手机是捡来的，且可能涉及非法所得（如盗窃、抢劫等），仍然进行刷机等处理，以帮助客户消除手机上的原有信息，从而掩盖手机的非法来源，那么店主的行为可能构成掩饰、隐瞒犯罪所得罪。
- 根据《中华人民共和国刑法》第三百一十二条的规定，明知是犯罪所得及其产生的收益而予以窝藏、转移、收购、代为销售或者以其他方法掩饰、隐瞒的，处三年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处或者单处罚金；情节严重的，处三年以上七年以下有期徒刑，并处罚金。
法律建议：
- 对于客户而言，捡到手机后应尽快联系失主或交给相关部门处理，而不是私自去手机店刷机。私自处理可能涉及非法占有他人财物等违法行为。
- 对于店主而言，在提供刷机等服务时，应询问手机的来源，并谨慎处理可能涉及非法所得的手机。如果怀疑手机的来源非法，应拒绝提供服务并报告相关部门。
可能后果：
- 如果店主因知情而参与非法活动，一旦被发现，将面临法律的制裁，包括有期徒刑、拘役、管制以及罚金等。
- 对于客户而言，如果捡到手机后私自处理并涉及非法活动，同样将面临法律的制裁。
总结：
店主是否有罪取决于其是否知道手机是捡来的以及是否参与了非法活动。在处理此类情况时，建议客户和店主都应谨慎行事，遵守法律法规，避免涉及非法活动。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。