结论：代保管的物资发生损失，在赔偿时一般不能直接做销售处理。这主要涉及到保管合同的责任归属以及会计处理的规范性问题。以下从法律和会计两个角度进行详细分析：
法律角度
保管合同的责任：
- 根据《中华人民共和国民法典》中关于保管合同的规定，保管人应当妥善保管保管物，因保管不善造成保管物毁损、灭失的，保管人应当承担损害赔偿责任。
- 在代保管物资发生损失的情况下，如果损失是由于保管人的过错（如疏忽、故意或重大过失）导致的，保管人需要承担赔偿责任。
赔偿与销售的区别：
- 赔偿是保管人因违反保管义务而向寄存人支付的经济补偿，其目的是弥补寄存人因物资损失而遭受的损失。
- 销售则是将物资的所有权转移给买方，并收取相应的价款。销售行为通常涉及物资的交付、价款的支付以及所有权的转移等法律行为。
- 因此，赔偿与销售在法律性质、目的和后果上均存在显著差异，不能混为一谈。
法律后果：
- 如果保管人试图将赔偿行为伪装成销售行为，以规避法律责任或逃避税务等义务，这可能构成欺诈或违法行为，将面临法律制裁。
会计角度
会计处理的规范性：
- 在会计处理上，赔偿和销售需要遵循不同的会计准则和规定。赔偿通常作为营业外支出或相关费用进行会计处理，而销售则作为营业收入进行会计处理。
- 将赔偿行为错误地归类为销售行为，将导致会计信息的失真和误导，违反会计处理的规范性和准确性要求。
税务影响：
- 赔偿和销售在税务处理上也存在差异。赔偿可能不涉及增值税等税费的缴纳，而销售则需要按照税法规定缴纳相应的税费。
- 错误的会计处理可能导致税务风险的增加，如漏缴税款、税务处罚等。
建议
- 明确责任归属：在代保管物资发生损失时，首先应明确责任归属。如果损失是由于保管人的过错导致的，保管人应承担赔偿责任。
- 合法合规处理：赔偿行为应依法进行，确保赔偿金额的合理性、赔偿方式的合法性以及赔偿程序的合规性。避免将赔偿行为伪装成销售行为或其他违法行为。
- 咨询专业意见：在处理代保管物资损失赔偿问题时，建议咨询专业律师或会计师的意见，以确保法律处理的准确性和会计处理的规范性。
如有任何关于公司法务、合同违约责任等方面的法律问题，可以直接向我咨询。