在建筑行业中，如果企业未按照规定及时办理建筑业企业资质证书的变更手续，即出现资质异常处理晚了的情况，这将会带来一系列的法律后果和行政处罚。

首先，根据《建筑业企业资质管理规定》第三十八条，企业若未及时办理资质证书变更手续，县级以上地方人民政府住房城乡建设主管部门会责令其限期办理。这是对企业的一种行政指令，要求企业在规定的时间内完成资质证书的变更。

如果企业在责令的期限内仍未办理，那么就会面临行政处罚。具体处罚标准根据违法行为的严重程度有所不同：

1. 轻微违法行为：如果企业逾期3日以下办理，通常不予罚款，但会受到警告或责令改正的行政处理。这表示企业虽然有所延误，但情节较轻，尚未造成严重后果。

2. 一般违法行为：如果企业逾期3日以上10日以下办理，将会被处以1000元以上5000元以下的罚款。这表示企业的延误行为已经较为明显，需要承担一定的经济责任。

3. 严重违法行为：如果企业逾期10日以上办理，或者拒不办理，或者造成了严重损害后果，将会被处以5000元以上1万元以下的罚款。这表示企业的行为已经严重违反了规定，需要承担较重的经济责任，并可能面临其他更严重的法律后果。

除了经济处罚外，企业还可能面临信誉受损、业务受限等间接后果。例如，资质异常可能会影响企业参与招投标活动的资格，导致企业失去重要的业务机会。同时，企业的信誉也会受到损害，影响其在行业内的声誉和地位。

因此，我建议企业在出现资质异常情况时，应尽快与相关部门沟通并办理变更手续，以避免不必要的法律后果和经济损失。同时，企业也应加强内部管理，确保资质证书的及时更新和有效管理，以维护企业的合法权益和业务发展。