结论：烟草公司不一定会立刻注销持证人的烟草专卖零售许可证，是否注销需根据具体情况及相关法律法规进行判断。
分析：
烟草专卖零售许可证的注销条件：
- 根据《烟草专卖许可证管理办法》等相关规定，烟草专卖零售许可证的注销通常涉及持证人不再从事烟草专卖零售业务、持证人死亡或丧失民事行为能力、许可证有效期届满未延续、许可证登记事项发生改变未办理变更手续且拒不改正等情形。
- 在您描述的情况下，即烟草持证人占了您的房子且不在这里经营，这并不直接等同于持证人不再从事烟草专卖零售业务。持证人可能只是暂时不在该地址经营，或者存在其他经营地址。因此，仅凭这一事实，并不能直接推断出烟草公司应立刻注销其许可证。
烟草公司的处理流程：
- 烟草公司在处理此类情况时，通常会进行调查核实。他们会确认持证人是否确实不再从事烟草专卖零售业务，或者是否存在其他违规行为。
- 如果烟草公司经过调查后确认持证人存在违规行为或不再符合持证条件，他们可能会依法注销其许可证。但这一过程需要时间，并且需要遵循一定的法律程序。
您的权利与救济途径：
- 如果您认为烟草持证人的行为侵犯了您的合法权益，例如非法占用您的房屋，您可以通过法律途径维护自己的权益。这可能包括向法院提起民事诉讼，要求持证人停止侵权行为并赔偿损失。
- 同时，您也可以向烟草公司或相关监管部门举报持证人的违规行为，要求他们进行调查处理。但请注意，举报应基于事实，并提供充分的证据支持。
建议：
- 在处理此类问题时，建议您先收集相关证据，如房屋产权证明、持证人占用房屋的证据、持证人不在此经营的相关证据等。
- 然后，您可以尝试与烟草持证人进行协商，看是否能够达成和解协议，解决纠纷。
- 如果协商无果，您可以考虑向烟草公司或相关监管部门举报持证人的违规行为，并要求他们进行调查处理。
- 同时，您也可以咨询专业律师，了解自己的法律权益和可能的救济途径，以便更好地维护自己的合法权益。
法律后果：
- 如果烟草持证人确实存在违规行为，且烟草公司或相关监管部门经过调查后确认其违规事实，那么持证人可能会面临许可证被注销、罚款等法律后果。
- 如果您通过法律途径维护自己的权益，并成功获得法院的支持，那么您可能获得相应的赔偿或恢复房屋的使用权等法律救济。