针对您提出的问题，即和用人单位签订了双方就业协议但没有签三方协议，现在准备去上研究生了会有什么影响，以下是我的详细解答：
首先，我们需要明确几个关键概念：
双方就业协议：这通常是您和用人单位之间达成的就业意向协议，它主要约束您和用人单位之间的行为，不涉及学校。这种协议的法律效力相对较弱，主要起到确认双方就业意向的作用。
三方协议：即《普通高等学校毕业生、毕业研究生就业协议书》，它是明确毕业生、用人单位和学校三方在毕业生就业工作中的权利和义务的书面表现形式。三方协议能解决应届毕业生户籍、档案、保险、公积金等一系列相关问题，且具有更强的法律效力。
现在，针对您的情况，分析如下：
对档案和户口的影响：
- 如果您没有签订三方协议，毕业后您的档案通常会派遣回原籍，即您的高中所在地或生源地。这不会影响您去上研究生，因为研究生的录取和档案的派遣是两个独立的过程。
- 如果您希望将档案保留在某个特定的人才市场或单位，通常需要签订三方协议。但既然您已经决定去上研究生，这一点就不再是主要考虑因素。
对研究生录取的影响：
- 签订双方就业协议并不会影响您被研究生院校录取。研究生的录取主要基于您的学术成绩、考试成绩和其他相关条件，与您是否签订就业协议无关。
对违约和赔偿的影响：
- 如果您和用人单位签订的双方就业协议中有违约金条款，且您因为去上研究生而违约，那么您可能需要按照协议支付违约金。但这一点取决于协议的具体内容，如果协议中没有明确规定，则通常不需要支付。
- 值得注意的是，即使需要支付违约金，其金额也应合理，且不应成为阻碍您追求更高学历的障碍。如果违约金过高或存在其他不合理条款，您可以尝试与用人单位协商解决。
建议：
- 既然您已经决定去上研究生，那么建议您尽快与用人单位沟通，说明您的情况，并协商解除双方就业协议。这样可以避免未来可能出现的纠纷和不必要的麻烦。
- 同时，您也可以咨询研究生院校的招生办公室或相关部门，了解他们在档案接收和派遣方面的具体要求，以便做好相应的准备。
综上所述，和用人单位签订双方就业协议但没有签三方协议，现在准备去上研究生了，通常不会对您产生太大的影响。但为了避免未来可能出现的纠纷和不必要的麻烦，建议您尽快与用人单位沟通并协商解除协议。