股东在不知情的情况下公司变更了注册资本，这种行为一般是不合法的。以下从几个角度详细分析：

1. 股东知情权与决策权：

   • 根据《公司法》的相关规定，股东有权了解公司的经营状况、财务状况以及重大决策事项，包括注册资本的变更。注册资本的变更属于公司的重大决策，通常需要经过股东会或股东大会的决议，并确保所有股东都得到充分通知并有机会参与决策。
   • 如果公司在未通知股东或未获得股东同意的情况下擅自变更注册资本，这侵犯了股东的知情权和决策权，股东可以依法主张自己的权益。

2. 公司变更注册资本的法定程序：

   • 公司变更注册资本需要遵循一定的法定程序，包括编制资产负债表及财产清单、通知债权人并公告、办理变更登记等。这些程序旨在保护公司、股东和债权人的利益，确保变更的合法性和透明度。
   • 如果公司未按照法定程序进行注册资本的变更，那么这种变更可能是无效的，股东可以对此提出异议并要求撤销变更。

3. 可能的法律后果：

   • 如果公司擅自变更注册资本且未获得股东同意，股东可以依法向法院提起诉讼，要求确认变更无效或撤销变更。
   • 同时，公司及其相关责任人员（如董事、高管等）可能因违反公司法规定而承担法律责任，包括但不限于赔偿损失、罚款等。

4. 实际操作建议：

   • 如果股东发现公司擅自变更了注册资本且自己不知情，应首先收集相关证据，如公司公告、股东会决议（如果存在的话）、银行转账记录等，以证明自己未参与决策且变更未获得自己同意。
   • 接着，股东可以与公司进行协商，要求公司撤销变更或采取其他补救措施。如果协商无果，股东可以依法向法院提起诉讼，维护自己的合法权益。

总结来说，股东在不知情的情况下公司变更了注册资本是不合法的，股东有权依法主张自己的权益并要求撤销变更或采取其他补救措施。如果你作为股东遇到了类似的问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议和帮助。