网上起诉时，被告是公司的话，该公司应为法人组织，而非非法人组织。以下从几个方面为你详细解释：

一、法人组织与非法人组织的定义及区别

1. 法人组织：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，法人是具有民事权利能力和民事行为能力，依法独立享有民事权利和承担民事义务的组织。公司作为典型的法人组织，具有独立的法律人格，能够以自己的名义进行民事活动，并承担相应的法律责任。

2. 非法人组织：非法人组织则是指不具有法人资格，但能够依法以自己的名义从事民事活动的组织。常见的非法人组织包括个人独资企业、合伙企业等。这些组织虽然能够从事民事活动，但并不具备独立的法律人格，其民事责任通常由其出资人或设立人承担。

二、网上起诉时被告公司的性质

在网上起诉的情境中，如果被告是公司，那么该公司必然是法人组织。因为公司作为法人，具有独立的法律地位，能够成为民事诉讼的被告。而非法人组织，如个人独资企业或合伙企业，虽然也可能成为民事诉讼的被告，但它们在法律地位上与公司存在显著差异。

三、网上起诉的流程及注意事项

1. 起诉流程：在网上起诉时，你需要准备起诉状、证据材料等，并通过法院的电子诉讼平台提交。在起诉状中，你需要明确被告的信息，包括被告的名称、住所、法定代表人或主要负责人的姓名等。如果被告是公司，你需要提供公司的营业执照信息或企业信用信息公示报告等，以证明其法人身份。

2. 注意事项：

   • 确保被告信息准确：在起诉前，务必核实被告的信息，确保起诉状中的被告名称、住所等信息准确无误。
   • 选择正确的管辖法院：根据民事诉讼法的规定，民事诉讼通常由被告住所地或合同履行地等法院管辖。你需要根据案件的具体情况选择正确的管辖法院。
   • 准备充分的证据材料：在网上起诉时，你需要准备充分的证据材料来支持你的诉讼请求。这些证据材料可以包括合同、发票、聊天记录等。

四、可能遇到的法律问题及建议

1. 被告身份确认问题：如果对被告的身份存在疑问，如无法确定其是法人组织还是非法人组织，你可以通过查询企业信用信息公示系统或咨询相关部门来确认。

2. 管辖权异议问题：如果被告对管辖法院提出异议，你需要根据民事诉讼法的相关规定进行答辩。在这种情况下，你可以寻求专业律师的帮助来制定答辩策略。

3. 证据提交问题：在网上起诉时，证据的提交可能受到一定的限制。你需要确保提交的证据材料清晰、完整，并符合法院的要求。如果遇到证据提交问题，你可以及时与法院沟通并寻求解决方案。

如果你在网上起诉过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。作为专注于医疗纠纷和行政诉讼领域的律师，我将为你提供专业、全面的法律服务。