结论：合同不见了，一般不影响办理营业执照，但需根据具体情况补充其他材料或证明。
办理营业执照的核心材料
根据《市场主体登记管理条例》及相关规定，办理营业执照通常需要以下材料：
- 申请书（明确公司类型、名称、经营范围等）；
- 股东身份证明（自然人提供身份证，法人提供营业执照）；
- 住所使用证明（如房产证、租赁合同等）；
- 公司章程（需全体股东签字）；
- 其他根据行业或地区要求的特殊材料（如前置许可文件）。
合同并非所有类型营业执照的必备材料，例如个体工商户注册可能仅需身份证和住所证明，因此合同丢失不一定直接导致无法办理。
合同丢失后的替代方案
若合同是证明经营场所、股权关系或合作内容的关键材料（如租赁合同、股东合作协议），可通过以下方式解决：
- 经营场所证明：若合同为租赁合同，可联系房东重新签订或出具《场地使用证明》，或提供房产证复印件+房东同意使用声明；
- 合作关系证明：若合同涉及股东合作，可通过公司章程、股东会决议等文件证明股权结构；
- 其他辅助材料：如银行流水、往来邮件、聊天记录等，可间接证明合同履行情况或合作意图。
特殊情况需注意
- 前置许可行业：若经营需审批的项目（如食品、教育、医疗等），合同可能是申请许可的依据，丢失后需向主管部门说明情况并补充材料；
- 外资或特殊主体：涉及外资、港澳台投资或特殊资质的企业，合同可能涉及外商投资审批，需按外商投资法律补充文件；
- 合同为唯一证明：若合同是证明经营合法性的唯一材料（如特许经营协议），需尽快与对方协商补签或公证遗失声明。
建议行动步骤：
- 确认办理营业执照的具体类型（个体/公司/外资等）及当地市场监管局要求；
- 梳理合同用途，判断是否为必备材料；
- 联系相关部门或对方补签合同、出具证明，或用其他材料替代；
- 提交材料时附上《情况说明》，解释合同丢失原因及补充措施。
如有其他细节需进一步分析（如合同类型、经营行业等），可随时向我补充说明，我会为您细化解答。