针对您提出的问题“档案在国企但只签了三方协议，国企能开档案托管证明吗”，以下是我的详细解答：
首先，需要明确的是，根据《人力资源社会保障部办公厅关于简化优化流动人员人事档案管理服务的通知》等相关规定，有人事档案管理权限的国有企业、国有控股企业和事业单位，应当依据有关规定做好本单位干部职工档案管理工作。这意味着，如果您所在的国企具有人事档案管理权限，并且您的档案已经由该单位接收并管理，那么该单位是有责任和义务为您管理档案的。
关于您提到的“只签了三方协议”的情况，三方协议通常是毕业生、用人单位和学校之间签订的一种就业意向协议，它并不等同于正式的劳动合同。然而，在实际操作中，很多国企在接收毕业生档案时，会基于三方协议作为接收档案的依据之一，尤其是在毕业生尚未正式毕业或尚未签订正式劳动合同的情况下。
接下来，针对您询问的“国企能否开档案托管证明”的问题，这主要取决于该国企的具体规定和操作流程。一般来说，如果您的档案已经由该国企接收并管理，且该国企具有开具档案托管证明的权限和流程，那么您是可以向该国企申请开具档案托管证明的。
为了顺利申请到档案托管证明，我建议您采取以下步骤：
联系国企人事部门：首先，您需要联系所在国企的人事部门或档案管理部门，了解他们对于开具档案托管证明的具体规定和流程。
准备相关材料：根据国企的要求，您可能需要准备一些相关材料，如身份证、三方协议、毕业证书等，以证明您的身份和档案托管情况。
提交申请并等待审核：将准备好的材料提交给国企人事部门，并填写相关的申请表格。然后，耐心等待他们的审核和处理。
领取档案托管证明：如果您的申请被批准，国企人事部门会为您开具档案托管证明，并通知您前来领取。
最后，我想强调的是，不同国企的具体规定和操作流程可能会有所不同。因此，在申请档案托管证明之前，最好先与所在国企的人事部门进行沟通，了解他们的具体要求和流程，以确保您能够顺利申请到所需的证明。