结论：转保证金给法人再由法人转入公司账户进行投标的行为，在特定情况下是有可能被查到的，这主要取决于资金流转的透明度、相关部门的监管力度以及是否存在违规行为等因素。

分析角度一：资金流转的透明度

1. 银行流水记录：银行作为资金流转的枢纽，会详细记录每一笔交易的双方信息、交易金额、交易时间等。因此，如果保证金从个人账户转至法人账户，再由法人账户转至公司账户，这一系列的转账记录都会在银行系统中留下痕迹。
2. 审计与监管：在投标过程中，相关部门（如招标机构、财政部门等）可能会对投标人的资金来源进行审计和监管。如果资金流转过程中存在异常或违规行为，很容易成为审计和监管的重点对象。

分析角度二：相关部门的监管力度

1. 反洗钱监管：根据反洗钱相关法律法规，金融机构有义务对大额交易和可疑交易进行报告和监控。如果保证金的转账行为被认定为可疑交易，金融机构可能会向相关部门报告，从而引发进一步的调查。
2. 招投标监管：在招投标过程中，相关部门会严格监管投标人的行为，包括资金来源、投标文件真实性等。如果发现投标人存在违规行为，如串通投标、虚假投标等，相关部门会进行调查并处理。

分析角度三：违规行为的后果

1. 法律责任：如果转保证金给法人再由法人转入公司账户的行为被认定为违规或违法，相关责任人可能会面临法律责任，包括罚款、没收违法所得、甚至刑事责任等。
2. 信誉损失：即使该行为未被直接认定为违规或违法，但如果被曝光或引发争议，也可能对公司的信誉造成损害，影响公司的业务发展和市场竞争力。

建议：

1. 遵守法律法规：在进行投标活动时，应严格遵守相关法律法规和招投标规定，确保资金来源的合法性和透明度。
2. 完善内部管理：公司应建立健全的内部管理制度，规范资金流转和投标行为，避免出现违规或违法行为。
3. 咨询专业意见：如果对投标过程中的资金流转或相关法律法规存在疑问，建议咨询专业律师或相关机构，以获取准确的法律意见和指导。

如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。