在男方不承认的情况下，纪委认定与他人发生并保持不正当性关系，通常会依据多方面的证据和线索来进行综合判断。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

1. 证据收集与审查：

   • 纪委在调查此类案件时，会首先注重证据的收集与审查。这包括但不限于通信记录（如短信、微信、电子邮件等）、监控录像、证人证言、物证（如照片、视频等）以及可能存在的其他间接证据。
   • 纪委会仔细审查这些证据的真实性、合法性和关联性，以确保它们能够形成完整的证据链，证明男方确实与他人发生了不正当性关系。

2. 调查程序与原则：

   • 纪委在调查过程中会遵循严格的程序和原则，包括保护当事人的合法权益、确保调查的公正性和客观性等。
   • 调查人员会与男方进行谈话，了解其陈述和辩解，并同时收集其他相关证据来验证其陈述的真实性。
   • 如果男方不承认，纪委会依据其他证据来形成判断，而不会仅凭男方的陈述来定案。

3. 不正当性关系的认定标准：

   • 不正当性关系通常指的是违反社会道德、婚姻伦理或法律法规的性关系。
   • 纪委在认定时，会考虑双方的关系性质、交往方式、频率以及是否存在利益输送等因素。
   • 如果证据显示男方与他人存在长期、稳定且秘密的性关系，且这种关系违反了社会道德或婚姻伦理，那么纪委很可能会认定其存在不正当性关系。

4. 男方不承认的影响与应对：

   • 男方不承认并不意味着纪委无法认定其存在不正当性关系。纪委会依据收集到的证据来形成判断，并可能通过进一步调查来获取更多证据。
   • 如果男方确实存在不正当性关系，但拒绝承认，纪委可能会考虑对其采取更严厉的纪律处分措施，以维护纪律的严肃性和公正性。

5. 法律后果与救济途径：

   • 如果纪委认定男方存在不正当性关系，并据此对其作出纪律处分决定，男方有权在规定时间内提出申诉或复核申请。
   • 在申诉或复核过程中，男方可以提供新的证据或理由来支持自己的主张，并请求纪委重新审查案件。

建议：

• 如果您或您身边的人面临此类情况，建议积极配合纪委的调查工作，如实陈述事实，并提供相关证据来支持自己的主张。
• 同时，也可以寻求专业法律人士的帮助，以更好地了解自己的权利和义务，并维护自己的合法权益。

在处理此类案件时，纪委会秉持公正、客观、严谨的态度，依据事实和法律来作出判断。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。