迟到三次直接开除是否合法，这并非一个简单的“是”或“否”的问题，而是需要综合考量多个因素。以下是我从不同角度为你进行的分析：
合法情况
规章制度明确且合法：
- 如果用人单位的规章制度中明确规定了“迟到三次属于严重违反公司制度的行为”，并且该规章制度的制定程序合法（如经过职工代表大会或全体职工讨论，并与工会或职工代表平等协商确定），内容合理且明确（对“迟到”有清晰界定，包括上班时间、允许的合理迟到缓冲时间等），同时已向劳动者公示或告知（如通过员工手册发放、培训、会议传达等方式），那么在这种情况下，迟到三次直接开除可能是合法的。
迟到行为确实严重：
- 即便规章制度中有相关规定，用人单位也需评估迟到行为是否确实对用人单位造成了重大影响或损失。如果迟到行为频繁且严重影响了工作秩序或公司运营，那么用人单位依据规章制度开除员工可能具有合法性。
不合法情况
规章制度存在瑕疵：
- 如果用人单位的规章制度未经民主程序制定，或内容明显不合理、不公正，甚至与法律法规相冲突，那么该规章制度可能被认定为无效。基于这样的规章制度开除员工自然也是违法的。
未履行告知义务：
- 如果用人单位未将相关规章制度向劳动者公示或告知，劳动者对“迟到三次将被开除”的规定并不知情，那么用人单位以此为由开除员工就缺乏合理依据，构成违法解除。
迟到行为不严重：
- 即便规章制度中明确规定了迟到三次属于严重违纪，但若迟到行为并未对用人单位造成重大损失或影响，用人单位仅凭此规定开除员工也可能被视为滥用权利，构成违法解除。例如，员工因突发情况（如交通堵塞、家庭紧急事务等）导致迟到，且事后及时向用人单位说明情况并补假，那么用人单位直接开除员工可能缺乏合理性。
法律后果与建议
法律后果：如果用人单位违法解除劳动合同，劳动者有权要求用人单位继续履行劳动合同；若劳动者不要求继续履行或劳动合同已经不能继续履行，用人单位则需依照经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。
建议：对于劳动者而言，如果面临因迟到被开除的情况，首先应要求用人单位出具书面的开除通知，并详细说明开除的具体原因和依据。如果认为用人单位的开除行为违法，可以尝试与用人单位进行协商解决；协商不成时，可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，要求用人单位支付违法解除劳动合同的赔偿金等。
总的来说，迟到三次直接开除是否合法取决于用人单位的规章制度是否合法、合理且明确，以及迟到行为是否确实构成了严重违反公司制度的行为。如果你或你身边的人遇到了类似的问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况为你提供更详细的法律建议。