证券公司违规是否会留案底，取决于违规行为的性质及后果。

1. 若违规行为构成犯罪：

   • 如操纵证券市场罪等，这是一种严重的犯罪行为。一旦被定罪，根据相关法律法规，犯罪行为的记录会被纳入个人档案，形成案底。这意味着该犯罪行为将伴随当事人一生，在其个人履历中留下不可磨灭的痕迹。案底可能对当事人的就业、升学、参与社会活动等方面产生不利影响，特别是对于一些背景审查较为严格的特定职业，如金融、法律等，有案底可能会导致当事人无法从事这些职业。

2. 若违规行为不构成犯罪：

   • 证券公司及其工作人员的违规行为若仅构成行政违法，如违反证券市场的监管规定，通常会受到行政处罚，如罚款、警告、吊销执照等，但并不会直接形成刑事案底。然而，这些行政处罚记录也可能在相关监管机构的档案中留存，对证券公司的信誉和后续业务开展产生一定影响。

3. 对于证券公司本身：

   • 证券公司的违规行为若被查实，不仅可能面临行政处罚，还可能受到监管机构的严格监管和限制，甚至可能被吊销业务许可。这些记录同样会在监管机构的档案中留存，对证券公司的长期发展产生不利影响。

综上所述，证券公司违规是否会留案底，需根据违规行为的性质及后果来判断。若构成犯罪，则会留有案底；若仅构成行政违法，则不会直接形成刑事案底，但可能受到行政处罚和监管限制。因此，证券公司应严格遵守相关法律法规和监管规定，确保合规经营。