作为乙方，如果合同丢失了，首先不要慌张，合同丢失并不意味着无法证明合同关系的存在或无法维护自身权益。以下是从多个角度为你提供的详细建议：
与甲方积极沟通：
- 及时告知：第一时间与甲方取得联系，诚恳地说明合同丢失的情况，并表达积极解决问题的态度。
- 协商补救：双方可以协商补签一份与原合同内容一致的合同，或者复印原合同的副本，并确保复印件上加盖与原件相同的印章或签字注明“与原件一致”，以增强其证明力。
全面查找合同备份与其他证据：
- 内部搜索：仔细梳理公司内部的文档管理系统、存储设备等，寻找合同的电子备份、复印件、扫描件或相关往来文件。
- 请求甲方协助：如果内部未找到备份，可以向甲方提出请求，希望其提供一份合同副本，并按照上述方法确保其法律效力。
- 收集间接证据：包括交易凭证（如发票、收据、银行转账记录）、往来函件（如邮件、短信）、履行记录（如货物交付单、验收报告）等，这些都能在一定程度上证明合同关系的存在及具体内容。
考虑特殊处理措施：
- 登报公示：在某些情况下，为了减少合同被他人恶意利用的风险，你可以考虑登报公示合同遗失信息。
- 补办手续：根据具体情况和相关机构的要求，携带必要的证明文件进行补办手续，如申请证明书、登报声明等。不过，这一步骤通常不是必须的，除非合同涉及特定行业或需要官方备案。
应对甲方不承认合同关系的情况：
- 收集更多证据：如果甲方不承认合同关系，你需要更加积极地收集其他证据来证明合同的存在和履行情况。这包括上述提到的交易凭证、履行记录、沟通记录等。
- 申请调解或诉讼：在收集到足够证据后，你可以考虑申请第三方调解机构介入调解，或者向有管辖权的人民法院提起诉讼。在诉讼过程中，你需要提交收集的证据来证明合同关系及甲方的违约事实。
预防措施与后续管理：
- 加强合同管理：为了避免类似情况再次发生，你应该加强合同管理，确保合同文件的妥善保管和定期备份。这包括建立完善的合同管理制度、使用专业的合同管理软件等。
- 定期审查与更新：定期对合同进行审查和更新，确保合同内容的准确性和完整性。同时，也可以考虑在合同中增加关于合同丢失或损坏的补救措施条款，以应对未来可能出现的类似情况。
在处理合同丢失问题时，你还需要注意以下几点：
- 保持冷静与积极：合同丢失虽然是一个棘手的问题，但保持冷静和积极的态度是解决问题的关键。不要因为情绪失控而做出错误的决策或行为。
- 及时咨询与行动：在发现合同丢失后，应该立即采取行动，与甲方沟通并收集证据。拖延时间可能会导致证据丢失或对方产生不信任感。
- 尊重法律程序：在处理合同纠纷时，应该尊重法律程序和规定。不要试图通过非法手段来解决问题，否则可能会面临法律责任和声誉损失。
最后，我想强调的是，合同丢失并不意味着无法维护自身权益。通过积极沟通、全面查找证据、考虑特殊处理措施以及加强后续管理等方式，你可以有效地应对合同丢失问题并保护自己的合法权益。如果你在这个过程中遇到任何法律问题或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。