关于租房合同中公对公交易时是否必须由乙方先开票甲方再付款的问题，这并非一个绝对的、由法律直接规定的流程，而是取决于双方合同中的具体约定以及交易习惯。以下从不同角度为你详细分析：

1. 合同约定优先：

   • 在公对公的租房合同中，双方的权利和义务首先由合同条款来界定。如果合同中明确规定了“乙方需先开具发票，甲方在收到发票后一定期限内付款”的条款，那么双方就应当遵循这一约定。这种情况下，乙方先开票甲方再付款就成为了合同履行的必要条件。
   • 反之，如果合同中没有这样的明确约定，或者约定了其他付款和开票的顺序，那么双方就应当按照合同中的其他约定来执行。

2. 交易习惯的影响：

   • 在商业实践中，公对公交易往往遵循一定的交易习惯。在某些行业或地区，可能存在“先开票后付款”的普遍做法。然而，这种习惯并不具有法律强制力，除非双方在合同中明确约定遵循该习惯。
   • 如果双方没有明确的合同约定，且对于交易习惯存在争议，那么就需要根据具体情况来判断。一般来说，如果一方能够证明某种交易习惯在当地或该行业中是普遍存在的，且对方在交易前对此是知情的，那么这种交易习惯可能会被视为合同的一部分，对双方产生约束力。

3. 法律原则的应用：

   • 在没有合同约定和交易习惯可循的情况下，双方可以依据《中华人民共和国民法典》等相关法律原则来协商解决。例如，根据诚实信用原则，双方应当诚实守信地履行各自的义务，不得损害对方的合法权益。
   • 如果因为开票和付款的顺序问题产生争议，双方可以尝试通过协商、调解等方式解决。如果协商不成，任何一方都有权向人民法院提起诉讼或依据合同中的仲裁条款申请仲裁。

4. 实际操作建议：

   • 为了避免因开票和付款顺序问题产生的争议，建议在签订租房合同时就明确约定好相关的条款。例如，可以约定“乙方应在收到甲方支付的租金后一定期限内开具发票”或“甲方应在收到乙方开具的发票后一定期限内支付租金”等。
   • 在合同履行过程中，双方也应当保持良好的沟通，及时就开票和付款等事宜进行确认和协商。如果因为特殊原因需要变更合同中的约定，也应当及时签订补充协议并明确变更后的权利和义务。

总结来说，租房合同中公对公交易时是否必须由乙方先开票甲方再付款，取决于双方合同中的具体约定以及交易习惯。为了避免争议和纠纷，建议在签订合同时就明确约定好相关的条款，并在合同履行过程中保持良好的沟通和协商。如果你在处理此类问题时遇到任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。