结论前置：拿工程合同是可以跟合伙人签合作协议的，但需根据具体情况和合作目的来设计协议内容，并确保协议合法有效。以下从多个角度进行分析：

1. 合作协议的法律基础：

   • 合作协议，本质上是一种合同，用于明确双方或多方在合作项目中的权利、义务和责任。在工程合同领域，如果与合伙人签订合作协议，该协议将作为双方合作的基础文件，规范双方的行为。
   • 根据《中华人民共和国民法典》中关于合同的规定，只要合作协议的内容不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，且双方意思表示真实，该协议即具有法律效力。

2. 合作协议与工程合同的关系：

   • 工程合同是业主与承包商之间就工程建设项目签订的合同，它规定了工程建设的范围、质量、工期、价款等关键条款。
   • 合作协议则是与合伙人之间就合作事项签订的合同，它可能涉及工程合同的履行、利润分配、风险承担等方面。合作协议可以是对工程合同的补充，也可以是独立于工程合同之外的协议，具体取决于双方的合作模式和需求。

3. 签订合作协议的注意事项：

   • 明确合作目的和范围：在合作协议中，应明确双方的合作目的、合作范围以及各自在合作中的角色和职责。
   • 规定利润分配和风险承担：合作协议应详细规定利润分配的方式和比例，以及风险承担的原则和方式，以避免未来可能出现的纠纷。
   • 确保协议合法有效：合作协议的内容应符合法律法规的规定，不得含有违法或无效条款。同时，双方应确保在签订协议时具有完全的民事行为能力，且协议是双方真实意思的表示。
   • 考虑工程合同的履行：如果合作协议与工程合同的履行密切相关，应在合作协议中明确工程合同的履行方式、时间节点等关键信息，以确保合作顺利进行。

4. 可能面临的法律后果：

   • 如果合作协议签订不当或履行过程中出现纠纷，双方可能面临法律诉讼或仲裁等法律后果。因此，在签订合作协议前，应充分评估合作风险，并考虑在协议中约定争议解决方式（如诉讼、仲裁等）。
   • 如果合作协议中的条款违反法律法规的强制性规定或公序良俗，该条款将被视为无效，但不影响其他条款的效力。然而，这可能导致双方对协议的理解产生分歧，进而引发纠纷。

建议：在拿工程合同跟合伙人签合作协议时，建议双方充分沟通、协商，明确合作目的和范围，并咨询专业律师的意见，以确保合作协议的合法性和有效性。如果未来在合作过程中遇到任何法律问题或纠纷，也可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律建议。