关于合伙企业转让上市公司股票是否免税以及是否合法的问题，这主要取决于具体的税务法规和政策，以及合伙企业的性质和合伙人的身份。以下是对这一问题的详细解答：
一、合伙企业转让上市公司股票的税务处理
纳税主体与税种：
- 合伙企业作为纳税义务人，在转让上市公司股票时，需依法申报并缴纳相关税款。
- 合伙人（包括普通合伙人和有限合伙人）也可能涉及个人所得税或企业所得税的缴纳。
主要税种：
- 增值税：上市公司股票买卖属于金融资产转让，需按6%税率缴纳增值税（但小规模纳税人可能享受减免政策）。不过，也有观点认为，若合伙企业转让的是非上市公司股权，则免征增值税；但针对上市公司股票，通常需缴纳增值税。
- 印花税：依据《印花税法》，股权转让合同需按价款的0.5‰贴花，买卖双方均需缴纳。
- 所得税：
- 企业所得税：若合伙人为法人或其他组织，则按25%税率缴纳企业所得税（符合小型微利企业等条件的可享受优惠税率）。
- 个人所得税：若合伙人为自然人，则适用“财产转让所得”项目，按20%税率缴纳个人所得税（也有观点认为，自然人合伙人可能按5% - 35%的超额累进税率计税，但特定情况下如直接按“财产转让所得”计税则为20%）。
特定税收优惠：
- 个人转让持有满1年的上市公司股票暂免征税（但这一优惠可能不适用于合伙企业作为整体转让股票的情况，需具体分析）。
- 符合条件的小型微利企业或高新技术企业可能享受所得税减免。
二、合法性分析
遵守税法规定：
- 合伙企业转让上市公司股票时，必须严格遵守相关税法规定，依法申报并缴纳税款。
- 任何试图逃避税款的行为都是违法的，并可能面临税务机关的处罚。
合规申报要点：
- 准备充分的申报材料，如股权转让协议、完税凭证、财务报表等。
- 在规定的申报期限内完成申报，如印花税需在签订协议次月15日内完成申报，所得税需在年度汇算清缴时一并申报。
三、结论与建议
结论：
- 合伙企业转让上市公司股票通常不是免税的，而是需要缴纳增值税、印花税以及所得税（根据合伙人性质不同而有所差异）。
- 只要严格遵守税法规定并依法申报缴纳税款，这一行为就是合法的。
建议：
- 在进行合伙企业股权转让时，建议咨询专业的税务顾问或律师，以确保准确理解并遵守相关税法规定。
- 合理规划税务负担，避免潜在的税务风险。
- 妥善保留所有与股权转让相关的文件和凭证，以备税务机关查验。