拥有软件著作权并不直接等同于软件在所有方面都是合法的。软件的合法性是一个综合考量的问题，需要从多个维度进行分析。以下是对这一问题的详细解释：
著作权与合法性的关系：
- 著作权是法律赋予软件开发者对其创作作品享有的一系列专有权利，它主要体现了对创作者劳动成果的尊重和保护。然而，著作权的存在并不直接等同于软件的全面合法性。著作权主要关注的是软件作为作品的创作成果方面，而对于软件的内容、功能及其运营行为的合法性，则需依据其他相关法律法规进行判断。
来源合法性：
- 软件的开发过程必须合法，不能侵犯他人的知识产权，如抄袭、剽窃等。若软件是基于侵犯他人权益而开发的，即使取得了著作权登记，该软件在本质上也是非法的。例如，未经许可使用他人独创性的算法或代码片段，即使软件整体申请了著作权，也因来源不合法而面临法律风险。
内容合法性：
- 软件的功能、用途及包含的信息必须符合法律法规的规定。软件不得用于非法目的，如传播淫秽、恐怖、暴力内容，或用于窃取用户信息、网络攻击等违法犯罪活动。若软件设计用于此类非法行为，即便拥有著作权，也会因其内容违法而被视为非法软件。
运营合法性：
- 软件的运营过程中也需遵守相关法律法规，包括取得必要的经营资质、保护用户信息、合法纳税等。例如，提供在线直播服务的软件需取得网络文化经营许可证等相关资质，否则即使软件本身拥有著作权，其运营行为也是违法的。
法律背景与建议：
- 根据《中华人民共和国著作权法》的规定，软件开发者在完成软件创作后，依法享有该软件的著作权。但这并不意味着软件在所有方面都合法。因此，在开发和使用软件时，除了关注著作权问题外，还需确保软件的来源、内容及运营均符合相关法律法规的要求。
- 对于软件开发者而言，建议在开发过程中严格遵守知识产权法律法规，确保软件的原创性和合法性。同时，在软件运营前，应仔细审查并确保取得所有必要的经营资质和许可，以避免因运营不合法而面临法律风险。
- 对于软件使用者而言，建议在使用软件前仔细审查软件的来源和合法性，避免使用来源不明或可能侵犯他人权益的软件。同时，在使用过程中也应遵守相关法律法规和软件的使用协议，以保护自己的合法权益。
综上所述，拥有软件著作权并不直接等同于软件在所有方面都是合法的。在开发和使用软件时，需综合考虑多个方面的因素，以确保软件的全面合法性。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。