结论：工伤认定中，劳动合同是否有效并不完全取决于是否加盖了公章，而是需根据具体情况综合判断。以下是对此问题的详细分析：
劳动合同的有效情况
有双方签字：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。在劳动关系中，若劳动合同上有双方的签字，即便没有公章，该合同仍可能有效。特别是当劳动者已实际到用人单位工作，且用人单位接受并安排工作、发放工资等，即双方已实际履行了劳动合同的主要内容，此时即便劳动合同未加盖公章，仅由法定代表人或授权代表签字，该合同也被视为有效。
有法定代表人或授权代表签字：
- 法定代表人作为用人单位的代表，其签字行为可视为用人单位的意思表示。授权代表在授权范围内签字，同样能体现用人单位的意志。因此，若劳动合同上有法定代表人或用人单位授权代表的签字，即便没有加盖公章，该合同也是有效的。
劳动合同的可能无效情况
既无公章又无签字：
- 如果劳动合同既没有加盖用人单位的公章，也没有法定代表人或授权代表的签字，仅仅是劳动者单方面签字，那么这种情况下劳动合同因缺乏用人单位的有效确认，通常会被认定为无效。因为无法明确该合同是否得到用人单位的认可，不符合劳动合同生效的形式要件。
用人单位否认且劳动者无法证明：
- 如果用人单位否认劳动合同的真实性，并且劳动者无法提供其他证据（如工资支付记录、工作证、考勤记录、同事证言等）来证明双方就劳动合同的内容达成一致并实际履行，那么该劳动合同的有效性也会面临挑战。
对工伤认定的影响及建议
- 影响：对于工伤认定而言，即便劳动合同被认定为无效，只要能通过其他证据证明劳动者与用人单位存在事实劳动关系，劳动者依然可以申请工伤认定并主张工伤保险待遇。
- 建议：为避免不必要的纠纷和风险，建议用人单位与劳动者在签订劳动合同时，最好同时加盖公章并由法定代表人或授权代表签字，以确保劳动合同的法律效力，切实保障双方的合法权益。若因此产生纠纷，劳动者应积极收集相关证据，如工资支付记录、工作证、考勤记录等，通过劳动仲裁等法律途径来维护自身权益。
示例说明：假设小张在一家公司工作，但劳动合同上只有公司法定代表人的签字，没有加盖公章。后来小张在工作中受伤，需要申请工伤认定。在这种情况下，只要小张能提供其他证据证明他与公司存在事实劳动关系（如工资支付记录、工作证等），他仍然可以申请工伤认定并主张工伤保险待遇。
综上所述，劳动合同的有效性并非完全取决于是否加盖公章，而是需要综合考虑多种因素。在实际操作中，应依据具体情况来判断劳动合同的效力，并确保双方权益得到有效保障。若您在此方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。