结论前置：非机动车在交通事故中负主要责任时，确实需要赔偿机动车的维修费用，但具体赔偿比例、方式及金额需结合事故实际情况、双方协商或法院判定来确定。
法律依据与原则
根据《中华人民共和国道路交通安全法》第七十六条的规定，机动车与非机动车驾驶人、行人之间发生交通事故，非机动车驾驶人、行人有过错的，根据过错程度适当减轻机动车一方的赔偿责任。这意味着，如果非机动车在事故中负主要责任，那么它就需要承担相应的赔偿责任，包括机动车的维修费用。
赔偿责任的确定
责任划分：
- 交通事故中的责任通常分为全部责任、主要责任、同等责任和次要责任。非机动车若被认定为主要责任，那么它可能需要承担70%-90%的赔偿责任，但具体比例需结合事故细节由交警部门或法院判定。
赔偿比例与方式：
- 赔偿比例：赔偿比例的确定会考虑非机动车一方的过错程度、机动车是否存在过错（如超速、违规变道等）以及事故的整体情况。例如，如果非机动车闯红灯导致事故，且机动车正常行驶，那么非机动车可能需要承担较高的赔偿责任。
- 赔偿方式：机动车的维修费用首先由交强险在无责赔偿限额内赔付（但通常这一限额较低，对于财产损失赔偿限额通常为100元，远不足以覆盖实际维修费用），超出部分由非机动车一方按责任比例承担。这包括车辆维修费、贬值损失等合理费用。
特殊情况处理：
- 如果非机动车驾驶人为行人、残疾人等弱势群体，且经济状况困难，法院在判决时可能会综合考虑这些因素，适当减轻其赔偿责任或允许分期赔偿。
- 如果机动车存在过错，如违规停车导致被撞，机动车也需承担相应责任，这会影响最终的赔偿比例和金额。例如，如果机动车违规停车，且非机动车因避让不及而发生事故，那么机动车可能需要承担部分责任，从而减轻非机动车的赔偿责任。
实际操作建议
及时报警与报案：
- 发生交通事故后，应立即报警并联系保险公司。交警将出具事故认定书，明确事故责任；保险公司则根据事故认定书和保险条款进行理赔。
协商与调解：
- 对于非机动车一方来说，若需承担赔偿责任，应首先尝试与机动车一方进行友好协商。协商不成时，可寻求交警部门或人民调解委员会的帮助进行调解。在协商和调解过程中，可以依据事故认定书和相关法律法规来明确各自的责任和赔偿金额。
法律途径解决争议：
- 若协商与调解均无法达成一致，非机动车一方可通过法律途径解决争议，包括提起诉讼或申请仲裁等。在诉讼或仲裁过程中，法院或仲裁机构将根据事故认定书、相关法律法规以及双方提供的证据来判定赔偿责任和金额。
举例说明
假设一起交通事故中，非机动车因闯红灯与正常行驶的机动车相撞，导致机动车受损。交警部门认定非机动车负主要责任，机动车负次要责任。在这种情况下，非机动车可能需要承担70%的赔偿责任，而机动车则承担30%的责任。如果机动车的维修费用为1万元，那么非机动车需要赔偿7000元，机动车自行承担3000元。当然，这一比例和金额还需根据具体情况和法院判决来确定。
综上所述，非机动车在交通事故中负主要责任时，确实需要赔偿机动车的维修费用。具体赔偿比例、方式及金额需结合事故实际情况、双方协商或法院判定来确定。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。