非机动车在交通事故中负主要责任时，确实需要赔付机动车的维修费用，但具体赔付比例和方式需结合事故实际情况、双方协商或法院判定来确定。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据与责任划分原则
根据《中华人民共和国道路交通安全法》第七十六条的规定，机动车与非机动车驾驶人、行人之间发生交通事故，责任划分遵循以下原则：
- 非机动车无过错时：若非机动车驾驶人、行人没有过错，由机动车一方承担全部赔偿责任。
- 非机动车有过错时：若有证据证明非机动车驾驶人、行人有过错，将适当减轻机动车一方的赔偿责任，具体减轻程度依据非机动车的过错程度确定。若非机动车一方负主要责任，通常可能需承担70%-90%的赔偿责任，但具体比例需结合事故细节由交警部门或法院判定。
二、赔付比例与方式
赔付比例：
- 非机动车负主要责任时，其赔付比例通常较高，可能达到70%-90%，但具体比例需根据事故中的实际过错程度、机动车是否存在过错（如超速、违规变道等）以及事故的整体情况来确定。
赔付方式：
- 保险赔付：若非机动车购买了相应的保险（如非机动车第三者责任险），可先由保险公司在保险限额内进行赔付。同时，机动车的交强险也将在其赔付范围内先行赔付机动车的维修费用（财产损失赔偿限额通常为2000元），不足部分再由非机动车按照责任比例承担。
- 个人承担：若非机动车未购买保险或保险赔付不足，剩余部分需由非机动车驾驶人个人承担。
三、特殊情况处理
非机动车驾驶人经济状况困难：
- 若非机动车驾驶人为行人、残疾人等弱势群体，且经济状况困难，法院在判决时可能会综合考虑这些因素，适当减轻其赔偿责任或允许分期赔偿。
机动车存在过错：
- 若机动车在事故中也存在过错，如违规停车导致被撞，机动车也需承担相应责任。这会影响最终的赔偿比例和金额，可能减轻非机动车的赔偿责任。
四、实际操作建议
及时报警与报案：
- 发生交通事故后，应立即报警并联系保险公司。交警将出具事故认定书，明确事故责任；保险公司则根据事故认定书和保险条款进行理赔。
协商与调解：
- 对于非机动车一方来说，若需承担赔偿责任，应首先尝试与机动车一方进行友好协商。协商不成时，可寻求交警部门或人民调解委员会的帮助进行调解。
法律途径解决争议：
- 若协商与调解均无法达成一致，非机动车一方可通过法律途径解决争议，包括提起诉讼或申请仲裁等。
举例说明：假设一起交通事故中，非机动车被判定负主要责任，承担80%的责任比例，机动车维修费用总计为10000元。那么，非机动车需赔付的金额为8000元（10000元 * 80%）。若非机动车购买了第三者责任险，且保险限额足够覆盖这8000元，则由保险公司进行赔付；若保险限额不足或未购买保险，则由非机动车驾驶人个人承担。
综上所述，非机动车在交通事故中负主要责任时，确实需要赔付机动车的维修费用。具体赔付金额和责任比例应根据交通事故责任认定和相关法律法规来确定。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。