结论：因总公司影响导致分公司不能注销，这一行为本身并不直接构成违法，但需根据具体情况判断是否违反了相关法律法规或合同约定，且总公司有义务确保分公司注销程序的合法合规进行。

详细分析：

1. 法律主体与注销义务：

   • 分公司作为总公司的分支机构，不具备独立的法人资格，其民事责任由总公司承担。因此，分公司的注销并非完全独立的行为，而是与总公司的经营状况和法律义务紧密相关。
   • 当总公司因某种原因（如解散、破产等）需要注销时，通常应同时处理分公司的注销事宜，以确保市场主体信息的准确性和市场秩序的稳定。若总公司未履行这一义务，可能面临行政处罚或法律责任。

2. 行政管理要求与注销程序：

   • 从工商行政管理部门等政府机构的视角来看，分公司注销需遵循法定的程序和要求，包括提交注销申请、完成清算、税务注销等手续。
   • 若因总公司原因导致分公司无法按时注销，可能违反了行政管理规定，导致分公司面临被强制注销、罚款或其他行政处罚的风险。

3. 合同约定与第三方权益：

   • 若分公司与第三方（如供应商、客户等）存在合同关系，且合同中约定了分公司注销的相关条款，那么总公司因自身原因导致分公司不能注销，可能构成对合同约定的违反，需承担相应的违约责任。
   • 此外，若分公司存在未了结的债务或法律事务，总公司作为民事责任承担者，有义务确保这些事务得到妥善处理，否则可能损害债权人的合法权益。

4. 特殊情况处理：

   • 在某些特殊情况下，如分公司仍有未完成的业务或存在其他需要继续经营的理由，可能无法直接注销。此时，总公司应依据相关法律法规与相关部门进行协商，并按照规定处理相关问题。
   • 但无论如何，总公司都不能忽视法律程序和规定，擅自决定不注销分公司或拖延注销时间，否则可能面临法律责任和行政处罚。

法律建议：

• 及时沟通：若因总公司原因导致分公司不能注销，建议总公司及时与相关部门（如工商行政管理部门、税务部门等）进行沟通，说明情况并寻求解决方案。
• 履行义务：总公司应确保分公司的注销程序合法合规进行，包括完成清算、税务注销等手续，并妥善处理分公司的债务和法律事务。
• 咨询专业：在处理分公司注销事宜时，若遇到复杂的法律问题或不确定的情况，建议及时向我咨询，以确保所有手续都合法合规地完成。

可能后果：

• 若总公司未履行注销义务或违反相关法律法规，可能面临行政处罚（如罚款、强制注销等）或法律责任（如承担民事赔偿责任等）。
• 若分公司因未注销而继续存续并从事经营活动，可能构成非法经营行为，面临更严重的法律后果。