休年假通常应算全勤，且公司不应因此扣减员工的全勤奖或影响其他福利待遇。以下从多个角度为你详细分析：

法律规定层面

1. 《职工带薪年休假条例》的相关规定

   • 根据该条例第二条，机关、团体、企业、事业单位、民办非企业单位、有雇工的个体工商户等单位的职工，连续工作1年以上的，享受带薪年休假。单位应当保证职工享受年休假，且职工在年休假期间享受与正常工作期间相同的工资收入。这表明年假是带薪的，应视为正常工作时间的一部分，因此休年假不应影响全勤的认定。

2. 《中华人民共和国劳动法》的相关规定

   • 劳动法第五十一条规定，劳动者在法定休假日以及依法参加社会活动期间，用人单位应当依法支付工资。年休假作为劳动者的法定假期，自然包含在内。因此，用人单位在员工休年假期间，必须依法支付工资，不得扣减任何形式的劳动报酬，包括全勤奖。

全勤定义与年假性质层面

• 全勤通常指员工在规定出勤时间内按时到岗，无迟到、早退、旷工、请假（除法定的带薪假期外）等缺勤情况。而年假作为员工的法定权利，不属于缺勤或旷工范畴。因此，从逻辑上讲，休年假并不违反全勤的定义，也不应被视为缺勤行为。

公司规章制度层面

• 尽管法律规定了年休假的性质和待遇，但具体是否扣除全勤还需参考公司的规章制度。不过，公司规章制度中关于年休假与全勤的规定，必须满足以下条件才具有法律效力：

  1. 经过合法程序制定：如经过民主程序讨论、公示或告知劳动者。
  2. 内容不违反法律法规的强制性规定：即不能违背《劳动法》、《职工带薪年休假条例》等相关法律法规。
  3. 合理性考量：若规章制度明显不合理，损害了劳动者的合法权益，即使经过合法程序制定，也可能被认定为无效。

• 实践中普遍做法：多数公司的规章制度会明确规定，休年假不影响全勤的认定和全勤奖的发放。因为年假是员工的法定权利，公司应尊重并保障员工的这一权利。

特殊情况考虑

• 若员工在休年假的同时存在其他缺勤情况（如病假、事假等），这些缺勤可能会影响到全勤保底工资的发放。但这与仅因休年假而被扣减全勤奖的情况是不同的。公司应合理区分员工的不同缺勤类型，并依据合法有效的规章制度进行考勤管理和奖金发放。

法律建议

1. 查看公司规定：首先，建议你查阅公司关于全勤和年假的具体规定，确保自身权益不受侵害。
2. 沟通协商：若公司规定与法律法规相悖，或你认为公司规定不合理，可与公司进行沟通协商，要求修正不合理规定。
3. 法律维权：在必要时，你可通过劳动仲裁等法律途径维护自身合法权益，确保休年假不影响全勤认定及相应福利待遇的发放。

综上所述，休年假通常应算全勤，且公司不应因此扣减你的全勤奖或影响其他福利待遇。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。