结论：大巴司机一般不会因乘客未赶上大巴导致空位而直接面临罚款，但具体是否会产生其他影响需分情况讨论。以下是详细分析：

1. 从交通法规和行业管理角度
   目前我国的《道路运输条例》及地方性客运管理规定中，并未明确将“乘客未赶上大巴导致空位”列为对司机的处罚情形。大巴司机的核心义务是按照核定线路、班次、时间安全运输乘客，只要司机按时发车、未违规操作（如甩客、拒载已购票乘客等），通常不会因空位被罚款。
   但需注意：若大巴公司或运输企业与司机签订的内部考核协议中约定“空位率影响绩效或奖金”，则可能因空位导致司机收入减少，但这属于企业内部管理范畴，与行政处罚无关。

2. 从合同关系角度（乘客与运输方）
   乘客购买大巴票后，与运输方（如客运公司）形成运输合同关系。若乘客因自身原因（如迟到）未赶上大巴，通常视为乘客违约，运输方无需退票或赔偿，但司机也不会因此承担责任。
   例外情况：若运输方未尽到提示义务（如未明确告知发车时间、未提供检票提醒服务），可能需承担部分责任，但处罚对象仍是运输企业而非司机个人。

3. 从实际运营角度
   大巴空位可能影响运输企业的收益，但企业通常会通过以下方式处理：

   • 将空位信息录入系统，供后续站点补售；
     
   • 若全程无补售，则视为正常运营损耗，不会直接归责于司机。
     除非司机存在故意拖延发车、私自改变路线等违规行为导致乘客误车，否则不会因空位被处罚。

建议：若您是乘客未赶上大巴，可联系运输企业协商退票或改签（部分企业允许免费改签一次）；若您是司机或运输企业工作人员，需确保运营合规，避免因操作不当引发纠纷。如有其他细节需进一步分析，可直接向我咨询。