结论：上级部门在未经过群众同意的情况下直接拍照是不可以的，这可能涉及侵犯公民的肖像权、隐私权等合法权益。
分析：
肖像权保护：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，自然人享有肖像权，未经肖像权人同意，不得制作、使用、公开肖像权人的肖像，但是法律另有规定的除外。这意味着，除非有明确的法律规定或特殊情况（如新闻报道、公共利益需要等，且需符合法定条件），否则未经个人同意，不得擅自拍摄、使用或公开其肖像。
隐私权保护：
- 隐私权是公民的重要权利之一，包括个人生活的安宁与私人信息秘密依法受到保护，不被他人非法侵扰、知悉、搜集、利用和公开等。如果拍照行为涉及个人隐私的泄露或侵犯，如拍摄个人私密场所、敏感信息等，同样可能构成对隐私权的侵犯。
行政行为的合法性：
- 即使上级部门出于行政管理的需要，也必须依法行事，尊重和保护公民的合法权益。未经群众同意直接拍照，可能缺乏法律依据，构成行政行为的违法或不当。
建议：
对于上级部门：
- 在进行任何涉及公民个人信息的活动时，应严格遵守法律法规，确保行为的合法性和正当性。
- 如果需要群众配合拍照，应事先征得其同意，并明确告知拍照的目的、用途和可能产生的后果。
- 对于已经拍摄的照片，应妥善保管，不得随意泄露或用于非法目的。
对于群众：
- 如果发现上级部门未经同意擅自拍照，可以要求其删除照片或采取其他补救措施。
- 如果认为自己的合法权益受到侵犯，可以向相关部门投诉或寻求法律援助，维护自己的合法权益。
可能的法律后果：
- 如果上级部门未经群众同意擅自拍照，并因此侵犯了公民的肖像权或隐私权，可能面临民事赔偿、行政处罚等法律后果。
- 在严重情况下，如果拍照行为涉及犯罪（如非法获取公民个人信息罪等），还可能承担刑事责任。
综上所述，上级部门在未经过群众同意的情况下直接拍照是不合法的，可能涉及侵犯公民的合法权益。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。