债权人可通过以下方式在法院执行转破产程序中保障自身利益：

1. 及时申报债权并参与债权人会议
   根据《企业破产法》第45条，债权人应在法院公告的债权申报期限内（通常为30日至3个月）提交书面债权申报材料，包括债权金额、性质、形成依据等。未按时申报的债权，在破产程序中可能无法参与分配。申报后，债权人可参与债权人会议，对破产财产管理、变价方案、分配方案等重大事项行使表决权，直接影响自身权益实现。

2. 监督破产管理人履职
   破产管理人由法院指定，负责接管债务人财产、调查债权、制定分配方案等。债权人可通过债权人委员会（如有）或直接向法院提出异议，监督管理人是否依法履职。例如，若发现管理人未及时追收债务人财产、低价处置资产等行为，可依据《企业破产法》第22条申请更换管理人或要求其纠正。

3. 主张优先受偿权
   若债权属于法定优先权范围（如建设工程价款优先权、职工工资债权、税收债权等），应在申报时明确主张并提交证据。根据《企业破产法》第109条，对债务人特定财产享有担保权的债权人（如抵押权人），可就该财产变价款优先受偿，剩余部分纳入普通债权分配。

4. 关注破产财产分配顺序
   破产财产分配遵循法定顺序：

   • 第一顺序：破产费用和共益债务；
     
   • 第二顺序：职工工资、医疗伤残补助、抚恤费用及社保费用；
     
   • 第三顺序：税收债权；
     
   • 第四顺序：普通债权。
     若破产财产不足以清偿同一顺序债权，按比例分配。债权人需核实自身债权性质，避免因顺序错误导致利益受损。

5. 申请债务人重整或和解
   若债务人具有重整价值（如持续经营能力、核心技术等），债权人可依据《企业破产法》第70条向法院提出重整申请，或参与债务人与全体债权人达成的和解协议。重整或和解成功后，债权人可能获得更高清偿率，但需承担一定风险（如重整计划执行失败可能转为破产清算）。

6. 追究债务人股东或高管责任
   若债务人存在股东抽逃出资、未履行出资义务、公司人格混同（如财产混同、业务混同）等情形，债权人可依据《公司法》及相关司法解释，在破产程序中申请追加股东为被执行人，或提起股东损害债权人利益责任纠纷之诉，扩大责任主体范围。

实务建议：

• 债权人应主动收集债权证据（如合同、转账记录、对账单等），确保申报材料完整；
  
• 关注法院公告，及时参与破产程序各环节，避免因消极行使权利导致利益受损；
  
• 若对破产程序有疑问，可直接向我咨询具体操作流程及风险防范措施。