持有摩托车驾照驾驶超标电动车的处罚需分情况讨论，具体如下：

1. 若超标电动车被认定为机动车（摩托车范畴）
   根据《道路交通安全法》第99条，驾驶与驾驶证准驾车型不符的机动车（如持E证驾驶电动摩托车但车辆实际参数超标），将面临200-2000元罚款，并处15日以下拘留，同时驾驶证记9分（依据《道路交通安全违法行为记分管理办法》第9条）。
   关键点：需通过车辆技术参数（如时速、重量、功率等）鉴定是否属于机动车，若商家宣传与实际不符，可主张免责但需举证。

2. 若超标电动车被认定为非机动车
   根据《道路交通安全法》第89条，驾驶非机动车违反交通法规（如未登记、逆行等），通常处5-50元罚款；但若因超标导致车辆性能接近机动车（如时速超25km/h），部分地区可能按“驾驶拼装车”处理，收缴车辆并强制报废。
   例外情形：若地方性法规明确将超标电动车纳入机动车管理（如北京、上海），则仍按第一种情形处罚。

3. 地方性法规的差异化处理
   部分城市（如深圳、杭州）通过地方立法对超标电动车实施更严格管理，例如：

   • 驾驶未登记超标电动车上路，直接扣车并罚款；
     
   • 持摩托车驾照驾驶超标电动车，可能被认定为“使用其他车辆号牌”，处5000元以下罚款并吊销驾照。
     建议：需查询当地《电动车管理条例》或咨询交管部门确认具体规定。

实务建议：

1. 购买电动车时要求商家出具《车辆一致性证书》，确认是否符合新国标（GB 17761-2018）；
   
2. 若车辆被鉴定为机动车，需办理机动车号牌、投保交强险并定期年检；
   
3. 遇到处罚争议时，可申请行政复议或提起行政诉讼，重点审查车辆鉴定报告的合法性。
   

如有进一步疑问（如具体城市处罚标准、车辆鉴定流程等），可直接向我咨询。