在行政诉讼中发现包庇渎职行为，应当根据具体情况选择向检察院或纪委反映，两者在职责和受理范围上有所不同。以下是对这一问题的详细分析：
一、向检察院反映
法律依据与职责：
- 检察院是国家的法律监督机关，负责监督法律的正确实施，包括对行政机关及其工作人员的执法活动进行监督。
- 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》及相关规定，检察院有权对涉嫌犯罪的行为进行立案侦查，包括行政诉讼中发现的包庇渎职行为，如果这些行为构成犯罪（如滥用职权罪、玩忽职守罪等）。
适用情形：
- 当行政诉讼中发现的包庇渎职行为涉嫌犯罪时，应当向检察院反映。
- 检察院将依法进行调查，如果查证属实，将依法追究相关人员的刑事责任。
反映方式：
- 可以向当地检察院的控告申诉部门提交书面材料，详细陈述包庇渎职的事实、证据及涉嫌的罪名。
- 也可以直接拨打检察院的举报电话进行反映。
二、向纪委反映
法律依据与职责：
- 纪委是党的纪律检查机关，负责维护党的章程和其他党内法规，检查党的路线、方针、政策和决议的执行情况，协助党的委员会加强党风建设和组织协调反腐败工作。
- 纪委有权对党员干部的违纪行为进行调查处理，包括行政诉讼中发现的包庇渎职行为，如果这些行为违反了党的纪律。
适用情形：
- 当行政诉讼中发现的包庇渎职行为涉及党员干部，且违反了党的纪律时，应当向纪委反映。
- 纪委将依法依规进行调查处理，如果查证属实，将给予相应的党纪处分。
反映方式：
- 可以向当地纪委的信访部门提交书面材料，详细陈述包庇渎职的事实、证据及违反的党纪条款。
- 也可以直接拨打纪委的举报电话或通过纪委的官方网站进行在线举报。
三、综合建议
明确行为性质：
- 在反映之前，应当尽可能明确包庇渎职行为的性质，判断其是否涉嫌犯罪或违反党的纪律。
- 如果行为既涉嫌犯罪又违反党的纪律，可以同时向检察院和纪委反映。
收集证据：
- 在反映之前，应当尽可能收集相关证据，包括书面材料、证人证言、视听资料等，以支持自己的陈述。
遵循法律程序：
- 在反映过程中，应当遵循法律程序，不得捏造事实或诬告陷害他人。
- 如果反映的内容不实或存在诬告陷害的情况，将可能承担相应的法律责任。
总结来说，在行政诉讼中发现包庇渎职行为时，应当根据具体情况选择向检察院或纪委反映。如果行为涉嫌犯罪，应当向检察院反映；如果行为涉及党员干部且违反了党的纪律，应当向纪委反映。如果行为既涉嫌犯罪又违反党的纪律，可以同时向两者反映。在反映过程中，应当遵循法律程序，收集相关证据，并明确行为的性质。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。