系统延迟入账是否算逾期，这主要取决于合同中的具体约定以及相关法律法规的规定。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

1. 合同约定角度：

   • 如果合同中明确规定了款项的到账时间，并且注明了延迟到账将视为逾期，那么在这种情况下，系统延迟入账确实会被视为逾期。合同是双方意思表示一致的产物，具有法律约束力，因此合同中的约定应当被严格遵守。
   • 如果合同中没有明确规定到账时间，或者虽然规定了时间但并未明确延迟到账的后果，那么在这种情况下，系统延迟入账是否算逾期就需要根据具体情况和相关法律法规来判断。

2. 法律法规角度：

   • 根据《中华人民共和国民法典》中关于合同履行的相关规定，当事人应当按照约定全面履行自己的义务。如果一方未按照约定履行义务，包括未按时支付款项，那么另一方有权要求其承担违约责任。然而，这并不意味着所有延迟入账的情况都会被视为逾期，还需要考虑延迟的原因、是否可归责于付款方等因素。
   • 在实际操作中，如果延迟入账是由于银行系统故障、网络问题等不可抗力因素导致的，且付款方能够及时提供相关证据证明其已经按时发起了支付指令，那么这种情况下可能不会被视为逾期。但如果延迟入账是由于付款方自身的原因，如操作失误、资金不足等，那么就很可能会被视为逾期。

3. 实际操作建议：

   • 对于付款方来说，为了避免因系统延迟入账而被视为逾期，建议在合同中明确约定到账时间以及延迟到账的后果，并尽量提前安排支付，以确保款项能够按时到账。
   • 对于收款方来说，如果遇到系统延迟入账的情况，应及时与付款方沟通，了解延迟的原因，并根据合同约定和相关法律法规来维护自己的合法权益。如果认为付款方存在违约行为，可以要求其承担违约责任，包括支付逾期利息、赔偿损失等。

总结来说，系统延迟入账是否算逾期并没有一个绝对的答案，而是需要根据合同中的具体约定以及相关法律法规的规定来判断。如果你在实际操作中遇到了相关问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议。