施工合同的签订主体需根据项目实际运作模式及法律关系确定，具体分为以下两种情形：

1. 发包单位直接签订的情形
   若项目由发包单位（如政府、开发商等）自行组织建设，未委托代建单位管理，则施工合同应由发包单位与施工单位直接签订。此时发包单位作为项目所有权人或投资人，直接承担合同权利义务。例如：某房地产公司自行开发住宅项目，直接与建筑公司签订施工合同。

2. 代建单位签订的情形
   若项目采用代建制模式（即发包单位通过招标或委托方式选定专业代建单位管理项目），则需分情况处理：

   • 授权代建：发包单位通过授权文件明确赋予代建单位签订施工合同的权限，此时代建单位可作为合同签订主体，但合同权利义务最终仍由发包单位承担（除非合同另有约定）。
     
   • 独立代建：若代建单位以自己名义与施工单位签订合同，且发包单位仅与代建单位存在委托合同关系，则施工单位原则上只能向代建单位主张权利。但若发包单位实际参与合同履行（如支付工程款），可能被认定为共同合同主体。
     

关键风险提示：

• 合同主体资格需符合《民法典》第143条（行为人具有相应民事行为能力）及《建筑法》第26条（施工单位需具备资质）等强制性规定。
  
• 若代建单位超越权限签订合同，可能构成无权代理，需发包单位追认后方能生效。
  
• 建议在代建合同中明确约定施工合同签订主体、付款方式及责任划分，避免纠纷。
  

实务建议：
签订前需核查项目立项文件、代建授权书等材料，确认实际合同主体。如有疑问，可提供具体项目模式（如是否涉及政府代建、PPP项目等），我将进一步分析法律关系。