合伙做工程的协议效力问题，需分情况讨论，具体如下：

1. 协议有效的情形：

   • 合同主体适格：合伙人必须具备相应的民事行为能力，即年满18周岁、精神状况正常，能够独立实施民事法律行为，并清楚知晓签订协议的法律后果及为自己的行为负责。例如，两位具有完全民事行为能力的自然人，自愿签订合伙承包工程的协议，且均具备相应的工程承包资质或至少一方具备资质并依法进行工程承包活动，该协议在主体上是适格的。
   • 意思表示真实：双方在签订协议时，应基于真实意愿达成合作意向，不存在欺诈、胁迫、重大误解等情形。例如，关于出资比例、利润分配、风险承担等核心条款，应经过充分协商后自愿签订，无任何一方在签订时受到不正当影响。
   • 内容合法合规：协议内容不得违反法律、行政法规的强制性规定，也不得违背公序良俗。具体条款如工程承包方式、质量标准、工期等应符合建筑行业相关法律法规和规范要求。例如，协议中约定的工程质量标准应符合国家或行业标准，工期安排应合理且符合工程实际需求。
   • 具备相应资质：根据建筑法等相关法律规定，承包工程需具备相应资质。因此，合伙人至少一方应具备法定的工程承包资质，否则协议可能因违反法律强制性规定而无效。若双方均具备资质，或至少一方具备资质并依法进行工程承包活动，则协议在资质方面是合法的。

2. 协议无效的情形：

   • 缺乏资质或违法转包、分包：若双方均不具备工程承包资质，或协议实质为非法转包、违法分包给无资质的个人，该协议将被认定无效。例如，两位均无工程承包资质的自然人签订合伙承包工程的协议，并试图以个人名义承包工程，该协议将因违反法律强制性规定而无效。
   • 损害国家、集体或第三人利益：协议内容若存在损害国家利益（如逃避税收）、集体利益（如侵占集体土地）或第三人利益（如恶意串通损害债权人利益）的情形，也将导致协议无效。例如，协议中约定通过虚假报账等方式逃避税收，或约定侵占集体土地进行工程承包活动，这些条款均将导致协议无效。

协议无效的法律后果：

• 一旦协议被认定无效，合同自始没有法律约束力。
• 双方已实际履行的部分，根据《民法典》规定，应返还因合同取得的财产；不能返还或无需返还的，应折价补偿。例如，若双方已按照无效协议进行了部分工程承包活动，并支付了相应的费用，这些费用在协议无效后应予以返还或折价补偿。
• 有过错的一方应赔偿对方因此遭受的损失；若双方均有过错，则应各自承担相应的责任。例如，若因一方缺乏资质导致协议无效，并给对方造成损失的，缺乏资质的一方应承担赔偿责任。

建议与防范措施：

• 在签订正式协议前，务必对协议内容进行详细审查和修改，以确保其合法性和有效性。可以寻求专业律师的帮助，对协议条款进行逐一审核，避免存在违法或无效的情形。
• 确认合伙人的资质和信誉，避免与不具备资质或信誉不佳的个人合作。可以通过查询相关资质证书、了解过往合作经历等方式进行核实。
• 明确协议条款，特别是关于出资、利润分配、风险承担、违约责任等方面的约定，以减少潜在的纠纷和风险。协议条款应具体、明确，避免使用模糊或歧义的表述。

综上所述，合伙做工程的协议效力取决于多种因素，包括合同主体、意思表示、内容合法性以及资质等。为确保协议的有效性和减少法律风险，建议在签订前进行充分的法律咨询和审查。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。