协议离婚时，可以且通常应当写清抚养权协议。以下从多个角度为你详细分析：

一、法律法规要求

根据相关法律法规，离婚协议书应当对子女抚养等事项协商一致。抚养权归属、抚养费的支付以及探视权等问题，是离婚协议的重要组成部分。这些规定旨在保障未成年子女的合法权益和健康成长，确保他们在父母离婚后仍能得到充分的关爱和照顾。因此，在协议离婚时，明确抚养权协议是符合法律法规要求的。

二、避免后续纠纷

明确约定抚养权相关事宜，有助于双方在离婚后避免因子女抚养问题产生不必要的争议。例如，如果没有明确约定抚养权，双方可能会就子女的居住、教育、医疗等问题产生分歧，甚至引发法律纠纷。这不仅会耗费双方的时间和精力，还可能对子女的成长环境造成不良影响。因此，在协议离婚时，写清抚养权协议是维护双方和谐关系、保障子女稳定成长环境的重要措施。

三、婚姻登记机关的要求

在办理协议离婚时，婚姻登记机关会要求双方提交离婚协议书，并对协议内容进行审查。如果离婚协议中未对抚养权进行明确约定，婚姻登记机关一般不会予以受理离婚申请。因为这被视为双方对涉及子女的核心问题没有达成一致安排，可能损害子女的利益。因此，为了顺利办理离婚手续，双方应当在协议中明确抚养权相关事宜。

四、抚养权协议的具体内容

在协议离婚时，抚养权协议应当包含以下具体内容：

1. 直接抚养方的确定：明确哪一方为子女的直接抚养方，即子女在日常生活中主要由哪一方照顾。这有助于确定子女的居住环境和日常生活安排。
2. 抚养费的支付：约定另一方如何支付抚养费，包括支付金额、支付方式及支付时间等。这可以确保子女在经济上得到充分的支持，满足他们的生活和学习需求。
3. 探视权的安排：明确非直接抚养方与子女的探视时间、地点、方式等。这可以保障非直接抚养方与子女的亲子关系不受影响，促进子女的健康成长。

五、特殊情况的处理

当然，也存在一些特殊情况。例如，如果夫妻双方没有子女，或者子女已经成年并具备独立生活能力，那么抚养权问题就不需要写在离婚协议书中了。在这些情况下，离婚协议可以更多地关注财产分割、债务处理等其他方面的事项。

总结与建议：

在协议离婚时，写清抚养权协议是符合法律法规要求、避免后续纠纷、满足婚姻登记机关要求的重要措施。协议内容应涵盖直接抚养方的确定、抚养费的支付以及探视权的安排等方面。如果你在协议离婚过程中遇到任何关于抚养权的问题或困惑，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议。