关于您提出的“流转土地户口分开一个人签协议是否有效”的问题，这主要涉及到代理权和合同效力的法律问题。以下是我为您提供的详细解答：
首先，我们需要明确的是，在农村土地流转或分割的情境中，如果户口已经分开，但其中一方（比如家庭中的某一成员）代表整个原家庭（或原土地承包户）与他人签订协议，该协议的效力取决于多个因素。
代理权：
- 如果签订协议的一方确实获得了其他家庭成员的明确授权，或者事后得到了其他家庭成员的追认，那么该协议是有效的。这是因为代理人在代理权限内，以被代理人的名义实施的法律行为，对被代理人发生效力。
- 在某些情况下，即使没有明确的书面授权，但如果相对方有理由相信代理人有代理权（比如基于家庭关系、过往行为模式等），且事后被代理人也未表示异议，那么该协议也可能被视为有效。这通常涉及到“表见代理”的法律原则。
合同双方的真实意思表示：
- 协议的有效性还取决于合同双方是否都是基于真实的意思表示而签订的。如果一方是在被欺诈、胁迫或误解的情况下签订的协议，那么该协议可能是无效的或可撤销的。
土地流转的合法性：
- 除了代理权和真实意思表示外，土地流转本身也必须符合法律法规的规定。比如，流转的土地必须是合法的承包地，流转的程序必须合法，且不得违反土地用途管制等规定。
户口分开的影响：
- 户口分开本身并不直接决定协议的效力。关键在于签订协议的一方是否代表整个原家庭（或原土地承包户）的意愿，以及是否获得了其他家庭成员的授权或追认。
具体到您的情境：
- 如果户口分开后，其中一方确实获得了其他家庭成员的授权或追认，且协议内容合法、双方真实意思表示一致，那么该协议是有效的。
- 如果户口分开后，签订协议的一方没有获得其他家庭成员的授权或追认，且相对方也没有理由相信其有代理权，那么该协议可能是无效的。
建议：
- 在签订土地流转协议前，最好明确所有家庭成员的意愿，并获得他们的明确授权或追认。
- 如果可能的话，可以请所有家庭成员共同签订协议，以避免后续的纠纷。
- 如果对协议的效力有疑问或担忧，建议咨询专业的法律人士或当地的相关部门（如农村土地管理部门）以获取更具体的法律建议。
希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的法律建议，请随时告诉我。