在交通事故中您负主责但对方不配合的情况下，您可以按照以下步骤来维护自己的合法权益：
沟通协商
- 直接沟通：尽管您负主责，但对方的不配合可能影响到事故的后续处理。您可以尝试与对方进行面对面的沟通，明确表达您的立场和愿意承担的责任，同时指出对方不配合可能带来的法律后果，如影响事故责任的最终认定或赔偿的顺利进行。
- 通过保险公司沟通：如果对方车辆有保险，您可以及时联系其保险公司，说明情况并请求保险公司介入处理。保险公司通常会根据保险合同和事故责任认定来协调双方进行赔偿。
请求调解
- 公安机关交通管理部门调解：根据《中华人民共和国道路交通安全法》第七十四条，您可以向公安机关交通管理部门申请调解。调解过程中，您可以详细阐述事故经过、责任认定以及您的赔偿意愿，同时听取对方的意见，争取达成双方都能接受的赔偿协议。
- 人民调解委员会调解：若双方同意，您也可以向人民调解委员会申请调解。人民调解委员会会组织双方进行协商，并尽力促成双方达成和解协议。该协议具有法律效力，如果对方不履行，您可以申请司法确认并强制执行。
法律途径
- 向法院提起民事诉讼：如果沟通协商和调解都无法解决问题，您可以准备充分证据后，向对方住所地或经常居住地的人民法院提起诉讼，要求对方承担相应的赔偿责任。法院将按照法定程序审理案件，并作出公正判决。
- 申请财产保全：在起诉前或诉讼过程中，如果您担心对方会转移财产以逃避赔偿，您可以向法院申请财产保全。法院将依法对对方的财产进行查封、扣押或冻结，以确保判决生效后您能顺利获得赔偿。
- 强制执行：如果对方拒不履行法院判决，您可以在规定期限内向法院申请强制执行。法院将采取多种措施强制对方履行赔偿义务，如查封、拍卖对方的财产等。
保留证据
- 在整个处理过程中，您务必妥善保存所有相关证据，包括事故责任认定书、医疗费用凭证、财产损失证据等。这些证据是后续维权的关键，能够证明您的损失和对方的责任。
针对您主责的情况，特别提醒：
- 尽管您负主责，但对方的配合程度并不影响您应承担的法律责任。您仍需按照事故责任认定来承担相应的赔偿责任。
- 如果对方的不配合导致您无法及时获得赔偿或增加了您的维权成本，您可以在诉讼中要求对方承担这些额外费用。
总结与建议：
面对对方不配合的情况，保持冷静和理性至关重要。您应充分利用法律赋予的权利，通过多种途径寻求解决方案。在整个过程中，注重证据的收集和保存是关键。如果您在处理过程中遇到任何困难或疑问，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供更具体的法律建议。