您好，关于您提出的“城镇户口在农村的自建房能否转让以及是否合法”的问题，这是一个涉及宅基地使用权和房屋所有权流转的复杂问题。以下是我根据相关法律法规和政策，为您提供的详细解答：
首先，我们需要明确的是，宅基地的所有权归村集体经济组织所有，而个人只具有宅基地的使用权，并不具备所有权。因此，宅基地本身是不能进行买卖的，也就是说，不能直接将宅基地转让给城镇户口的个人。
然而，在宅基地上建造的房屋，其所有权是可以转让的。这是因为房屋作为可以移动的财产，其所有权的转让可以包括对宅基地使用权的一并转让。但这种转让并不是无条件的，它必须遵循一系列严格的条件和法规。
具体来说，如果城镇户口的个人想要购买农村的自建房，需要满足以下条件：
征得村委会同意：宅基地使用权转让前，必须得到所在村委会的同意，以保障村集体的利益。
受让人资格：虽然城镇户口的个人在理论上不能直接成为宅基地使用权的受让人，但如果通过购买房屋的方式间接获得宅基地使用权，那么需要确保该房屋的转让是合法的，并且受让人（即城镇户口的个人）在购买后不会违反宅基地政策的相关规定。不过，实际操作中，由于宅基地使用权的特殊性，城镇户口个人购买农村房屋并获得宅基地使用权的情况往往受到严格限制，甚至在很多地方是不被允许的。
房屋和宅基地的流转条件：宅基地使用权的流转通常需要遵循一定的程序和条件，包括获得村委会的同意、符合宅基地政策规定等。此外，受让人在购买房屋时，不得已经拥有宅基地使用权，以避免同一人拥有多处宅基地。
不得再申请宅基地：根据法律规定，农村村民在出卖、出租、赠与住宅后，不得再次申请宅基地。这一规定同样适用于通过购买房屋间接获得宅基地使用权的情况。
关于合法性：
如果城镇户口的个人试图直接购买宅基地或违反上述条件购买农村房屋，那么这种转让行为很可能是不合法的，因为它违反了宅基地政策的相关规定。
如果城镇户口的个人在符合相关法律法规和政策的前提下，通过合法途径购买农村房屋，并间接获得宅基地使用权（尽管这种情况在实际操作中受到严格限制），那么这种转让行为在形式上可能是合法的，但具体还需根据当地政策和实际情况来判断。
建议：
由于宅基地和农村房屋的转让涉及复杂的法律法规和政策问题，我建议您在考虑购买农村房屋前，先咨询当地的村委会、土地管理部门或法律专业人士，了解具体的政策和法律规定。
如果您确实对农村房屋有购买需求，可以考虑通过租赁、合作开发等合法方式来实现，以避免涉及宅基地使用权的转让问题。
综上所述，城镇户口在农村的自建房能否转让以及是否合法，取决于具体的转让方式和是否符合相关法律法规和政策的规定。希望我的解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的咨询，请随时告诉我。