在挂靠公司垫资的问题上，责任归属并非一概而论，而是需要根据具体的挂靠协议内容、实际资金使用情况以及相关法律法规来综合判断。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：

1. 挂靠协议约定：

   • 协议内容决定责任：挂靠协议是挂靠方与被挂靠方之间关于权利义务的约定。如果协议中明确规定了垫资的责任归属，比如约定由挂靠方自行承担垫资风险，或者由被挂靠方在特定条件下承担垫资责任，那么应当按照协议约定来执行。
   • 无约定或约定不明：如果挂靠协议中没有明确约定垫资的责任归属，或者约定不明确，那么就需要根据实际情况和相关法律法规来推断责任。

2. 实际资金使用情况：

   • 资金流向：需要查明垫资的资金实际流向了哪里。如果资金确实用于了挂靠项目的建设，且被挂靠方作为项目的名义主体，可能在一定程度上需要承担垫资的责任，尤其是当挂靠方无法承担时。
   • 资金管理：如果被挂靠方对资金进行了有效的管理，并能够证明资金的使用符合项目需求，且没有挪用或滥用资金，那么被挂靠方可能不需要承担垫资责任。

3. 相关法律法规：

   • 建筑法相关规定：根据《中华人民共和国建筑法》等相关法律法规，挂靠行为本身是违法的，可能面临行政处罚。在违法挂靠的情况下，如果发生垫资纠纷，法院可能会根据违法情况对责任进行划分，可能倾向于保护实际施工人的利益。
   • 合同法原则：在挂靠协议合法有效的前提下（尽管挂靠行为本身违法，但协议内容可能部分有效），根据合同法的原则，当事人应当按照约定履行自己的义务。如果协议中约定了垫资责任，那么应当按照约定执行。

4. 实际案例与司法实践：

   • 案例参考：在实际案例中，法院通常会根据挂靠协议的具体内容、实际资金使用情况以及双方的过错程度来综合判断垫资责任的归属。例如，如果挂靠方能够证明资金确实用于了项目，且被挂靠方存在过错（如未及时支付工程款等），那么法院可能会判决被挂靠方承担部分或全部垫资责任。
   • 司法倾向：在司法实践中，法院也倾向于保护实际施工人的利益，尤其是在挂靠方为实际施工人且确实为项目垫资的情况下。

建议：

• 明确协议内容：在挂靠关系中，双方应当明确约定垫资的责任归属，以避免后续纠纷。
• 保留证据：无论是挂靠方还是被挂靠方，都应当保留好与垫资相关的所有证据，如资金流向证明、支付凭证等。
• 寻求法律帮助：如果发生垫资纠纷，建议及时咨询专业律师，以便根据具体情况制定合适的维权策略。

最后，挂靠公司垫资的责任归属是一个复杂的问题，需要根据具体情况和相关法律法规来综合判断。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。