通过中介公司交易房产时签订的协议，在满足一定条件下是具有法律效应的。以下是对这一问题的详细分析：
一、协议具有法律效应的前提条件
合同主体适格：
- 中介公司必须是依法成立并具有相应经营资质的合法主体，例如持有房地产中介服务机构备案证明等。
- 买卖双方也需具备相应的民事行为能力，能够独立承担民事责任。出卖人应是房屋的合法产权人，买受人则需达到法定年龄，精神状态正常。
意思表示真实：
- 双方当事人在签订协议时，必须基于真实意愿，不存在欺诈、胁迫、重大误解等情形。例如，卖方不得故意隐瞒房屋的重大质量问题，买方也不得在被胁迫的情况下签署合同。
内容合法合规：
- 协议内容不得违反法律法规的强制性规定，如不得涉及非法转让、侵犯他人权益等情形。同时，协议中的各项条款，如房屋价格、交付时间、付款方式、违约责任等，均需合法合规。
形式符合要求：
- 房屋买卖协议通常要求采用书面形式订立，并应明确约定房屋的基本信息、价款、支付方式、交付时间等关键条款。这是确保协议有效性的重要形式要件。
二、协议可能无效的特殊情况
中介越权代理：
- 如果中介未经买卖双方授权，擅自以买卖双方名义签订房屋买卖协议，该协议可能因无权代理而无效。但买方或卖方可以选择追认该协议，使其自始有效。
阴阳合同：
- 为了避税或其他目的，买卖双方有时可能会签订两份价格不同的合同（即“阴阳合同”）。此类合同中的低价合同可能因恶意串通损害国家利益而被认定为无效。
三、法律建议
仔细审查中介资质：
- 在通过中介签订房屋买卖协议前，务必仔细审查中介公司是否具备相应的资质和营业执照，以确保中介服务的合法性和专业性。
认真阅读协议条款：
- 在签订协议前，务必认真阅读协议条款，确保内容清晰、合法，并理解其全部含义。如有任何疑问或担忧，应及时向中介或专业律师咨询。
保留相关证据：
- 在交易过程中，务必保留好所有与交易相关的证据，如协议、付款凭证、房屋产权证明等。这些证据在发生纠纷时将起到至关重要的作用。
及时履行协议义务：
- 签订协议后，双方应严格按照协议约定履行各自义务，以确保交易的顺利进行。如有任何违约行为，将可能承担相应的法律责任。
综上所述，通过中介公司交易房产时签订的协议，在满足合同主体适格、意思表示真实、内容合法合规以及形式符合要求等条件下是具有法律效应的。如有任何疑问或担忧，建议直接向我咨询，以确保自己的合法权益得到妥善保护。