专利权诉讼时效确实已经改为三年，但这一规定并非适用于所有与专利相关的纠纷，而是主要针对专利侵权纠纷及部分特定情形。以下是对这一问题的详细分析：
一、专利侵权纠纷的诉讼时效
基本规定：
- 根据《中华人民共和国民法典》第一百八十八条及《中华人民共和国专利法》的相关规定，侵犯专利权的诉讼时效为三年。这一时效自权利人知道或者应当知道其权利受到损害以及具体的义务人（即侵权人）之日起计算。
时效起算：
- 诉讼时效的起算必须同时满足两个条件：权利人知道或应当知道存在侵权行为，并且知道或应当知道具体的侵权人是谁。仅知道侵权行为而不知道具体侵权人时，诉讼时效尚未开始起算。
- 对于发明专利，如果在申请公布后至专利权授予前，他人未经许可使用了该发明且未支付适当使用费，专利权人要求支付使用费的诉讼时效也是三年。但此时效的起算点有所不同：如果专利权人在专利权授予之日前已经知道或应当知道他人使用其发明，那么时效自专利权授予之日起计算；否则，自专利权人知道或应当知道他人使用其发明之日起计算。
超过诉讼时效的后果：
- 一旦超过诉讼时效，若对方当事人提出诉讼时效抗辩，权利人将可能丧失胜诉权，即法院不会支持其诉讼请求。然而，这并不意味着权利人的实体权利本身消灭，只是失去了通过法律手段强制对方履行义务的机会。
- 除了三年的诉讼时效外，还存在一个二十年的最长保护期限。如果专利权人的权利自受到损害之日起已经超过二十年，即使未超过三年的诉讼时效，人民法院也不会支持其诉讼请求。
二、特殊情形的诉讼时效
持续侵权的特殊处理：
- 若权利人超过三年起诉，且侵权行为在起诉之日仍在继续，则在专利权有效期内，人民法院仍应判决被告停止侵权行为，并赔偿自权利人向人民法院起诉之日起至判决生效之日止的损失。这意味着，即使超过了基本的三年时效，只要侵权行为持续存在，权利人仍有权要求停止侵害并获得相应赔偿。
宣告专利权无效及相关强制许可使用费的诉讼时效：
- 对于宣告专利权无效的请求，以及与之相关的强制许可使用费裁决或决定的诉讼，诉讼时效均为三个月，且自收到通知之日起算。
三、法律建议
及时维权：
- 在发现专利权受到侵害时，权利人应及时采取措施，包括收集证据、咨询专业律师等，以确保在法定的诉讼时效期间内提起诉讼，维护自身合法权益。
关注时效起算点：
- 权利人应密切关注诉讼时效的起算点，确保在知道或应当知道权利受到损害及义务人之日起三年内提起诉讼。对于发明专利申请公布后至专利权授予前的使用费纠纷，更需注意时效的起算点。
持续侵权的应对：
- 对于持续侵权的情形，权利人即使超过三年起诉，仍有权要求停止侵害并获得相应赔偿。但为避免不必要的法律风险，建议权利人尽早采取行动。
总结来说，专利权诉讼时效已改为三年，但具体适用情形需根据案件事实和法律规定来确定。在处理专利纠纷时，权利人应仔细分析案件事实和相关法律规定，以确定适用的诉讼时效，并及时采取行动维护自身权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。