若动迁协议补办后又找到原件，通常建议根据实际情况选择保留原件或妥善处理补办件，同时确保协议的法律效力不受影响。以下是具体分析和建议：

1. 评估补办件与原件的法律效力

   • 补办件的法律效力：在动迁协议丢失后，通过合法程序补办的协议通常具有与原件相同的法律效力。这是因为补办过程往往涉及相关部门的确认和盖章，确保了协议的真实性和合法性。
   • 原件的法律效力：原件作为最初签订的协议，自然具有法律效力。在找到原件后，需要确认其是否完整、未受损，并且与补办件的内容一致。

2. 根据实际情况选择处理方式

   • 保留原件，销毁或妥善保管补办件：如果原件完整无损，且你希望保留最原始的协议作为法律凭证，那么可以选择保留原件，并妥善处理补办件（如销毁或单独存放，以备不时之需）。但在此过程中，需确保补办件不会被误用或泄露个人信息。
   • 继续保留补办件，原件作为备份：考虑到原件可能因时间久远而损坏或丢失的风险，你也可以选择继续保留补办件作为日常使用的协议，而将原件作为备份妥善保管。这种方式可以确保在需要时随时提供协议副本，同时保护原件不受损害。

3. 确保协议的法律效力不受影响

   • 无论选择哪种处理方式，都需要确保协议的法律效力不受影响。这包括保持协议的完整性、未受损状态，以及确保协议上的签名、盖章等法律要素齐全且有效。
   • 如果在处理过程中遇到任何疑问或不确定的情况，建议咨询相关部门或专业人士的意见，以确保你的权益得到充分保障。

4. 注意事项

   • 在处理动迁协议时，务必保持谨慎和细心。任何对协议的改动或损坏都可能影响其法律效力。
   • 如果可能的话，建议将协议存放在安全、干燥的地方，并避免与尖锐物品或腐蚀性物质接触，以延长其使用寿命。