结论：舅舅和外公可以做亲子鉴定，但通常不能直接用于“落户”目的，除非在特定情况下作为辅助证明材料。

详细分析：

1. 亲子鉴定的适用范围
   亲子鉴定是通过DNA技术确认生物学亲子关系的科学手段，其结果具有法律效力，可用于确认父子、母子等直系血缘关系。舅舅（母亲的兄弟）与外公（母亲的父亲）属于旁系血亲，他们的亲子鉴定只能证明两人之间的血缘联系（如外公是舅舅的父亲），但无法直接证明“落户申请人”与户主（如外公）的亲子关系。

2. 落户的法定要求
   根据中国户籍管理规定，落户通常需证明申请人与户主的直系亲属关系（如父子、母子、祖孙等）。例如：

   • 未成年人投靠父母或祖父母；
     
   • 父母投靠子女等。
     若需通过亲子鉴定落户，一般需提供申请人与户主的直接亲子关系证明（如父亲与子女、母亲与子女），而非旁系亲属（如舅舅与外公）的鉴定结果。

3. 特殊情况下的辅助作用
   在极少数情况下，若因历史原因（如领养、户籍登记错误）导致直系亲属关系无法直接证明，舅舅与外公的亲子鉴定可能作为间接证据，辅助证明家庭关系链条。例如：

   • 若需证明“申请人”是外公的外孙/外孙女，但母亲已故且无其他直接证据，可通过舅舅与外公的亲子鉴定，结合其他材料（如母亲与舅舅的亲属关系证明、申请人出生证明等）间接推导。
     
   • 但此类情况需户籍部门具体审核，且通常需补充其他证据形成完整证据链。

4. 实务建议

   • 明确落户类型：先确认落户的具体情形（如投靠落户、出生落户、补录户口等），不同类型对材料要求不同。
     
   • 咨询户籍部门：直接向拟落户地的派出所或户籍科咨询，了解是否接受旁系亲属的亲子鉴定及需补充的其他材料。
     
   • 准备完整证据：若需间接证明关系，建议同步准备出生证明、亲属关系公证书、村/居委会证明等材料，提高审核通过率。

总结：舅舅与外公的亲子鉴定本身不能直接用于落户，但在特定情境下可能作为辅助材料。建议根据具体落户类型，提前与户籍部门沟通并准备完整证据链。如有进一步疑问，可继续向我咨询细节。