在医疗领域腐败案件中，对违法所得的认定一般不需要扣除正常市场份额。以下是对这一问题的详细分析：

一、违法所得的认定原则

违法所得的认定，通常遵循的是“全部收入说”或“利润说”的原则，具体取决于案件的性质和法律规定。在医疗腐败案件中，由于涉及的是非法行为（如受贿、回扣等）所获得的利益，因此更倾向于采用“全部收入说”，即认定违法所得为行为人通过非法行为所获得的全部收入，而不扣除其正常经营或业务活动中的成本或市场份额。

二、医疗腐败案件的特殊性

医疗腐败案件往往涉及复杂的利益关系和隐蔽的非法行为。在这些案件中，违法所得可能以多种形式存在，如现金、礼品、旅游、股份等。这些非法利益往往与正常的医疗业务活动交织在一起，难以准确区分哪些是正常市场份额，哪些是非法所得。因此，为了严厉打击医疗腐败行为，维护医疗市场的公平竞争和患者的合法权益，通常不会对违法所得进行扣除正常市场份额的处理。

三、法律依据与司法实践

1. 法律依据：虽然具体的法律规定可能因地区和案件类型而有所不同，但一般来说，反腐败法律、刑法以及相关的司法解释都明确规定了违法所得的认定和处理原则。这些规定通常强调对非法行为的严厉打击和对违法所得的全面追缴。

2. 司法实践：在司法实践中，法院在审理医疗腐败案件时，通常会根据案件的具体情况和相关法律规定，对违法所得进行全面认定和追缴。这包括行为人通过非法行为所获得的全部收入，无论其是否以正常市场份额的形式存在。

四、可能的例外情况

当然，也存在一些可能的例外情况。例如，如果行为人能够证明其通过非法行为所获得的利益中，有一部分是与其正常业务活动直接相关且合理的成本或费用，那么这部分利益可能会在认定违法所得时被适当扣除。然而，这种情况在医疗腐败案件中相对较少见，且需要行为人提供充分的证据来支持其主张。

五、法律建议

对于涉及医疗腐败案件的当事人来说，重要的是要认识到违法所得的认定和处理原则，并积极配合司法机关的调查和审判工作。如果当事人认为自己的合法权益受到了侵害，或者对违法所得的认定有异议，可以通过法律途径来维护自己的权益。同时，我也建议医疗机构和医务人员加强自身的法律意识和合规意识，避免陷入医疗腐败的泥潭。

如果您在医疗医患领域遇到任何法律问题或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。我会根据您的具体情况和需求，提供专业、全面的法律建议和帮助。