关于非法行医罪中违法所得的认定，这是一个涉及刑法具体适用的问题，我可以为你详细解答。

非法行医罪中违法所得的认定，主要是指行为人通过非法行医行为所获得的全部财物，这些财物是直接与非法行医行为相关的经济利益。具体来说，违法所得的认定应包含以下几个方面：

1. 经营收入：这包括通过非法行医行为所获得的全部货币收入，如收取的诊疗费用、手术费、药品销售款等。这些收入是直接因非法行医行为而产生的经济利益流入。

2. 成本扣除的争议：在计算违法所得时，是否扣除成本存在不同的观点。一种观点认为应扣除为实施非法行医行为而支付的合理成本，如购进药品、医疗器械的成本，租赁诊疗场所的费用等；但另一种观点认为，违法所得的计算不应考虑成本，而应直接以实际收取的费用数额确定。根据目前的司法实践，通常不扣除成本，而是直接计算实际收入。

3. 持续时间内的累计：如果非法行医行为是持续进行的，那么违法所得应是在该持续期间内所获得的全部收入总和，而不是某一次或某一段时间的收入。

4. 相关财物的价值：除了货币收入外，还应包括与非法行医行为相关的其他财物的价值，如非法行医过程中赠送的药品、医疗器械等物品的市场价值，这些也应计入违法所得。

在认定违法所得时，需要特别注意以下几点：

• 要将非法行医过程中合法的医疗服务收入排除在外，只计算因非法行医而额外获得的财物。
• 对于通过非法行医行为获取的药品、医疗器械等物品，若其具有经济价值，也应计入违法所得。
• 要综合考虑非法行医的时间、范围、情节等因素，对违法所得进行合理的计算和认定。

综上所述，非法行医违法所得的认定是一个复杂的过程，需要综合考虑多个方面。如果你在具体案件中面临此类问题，建议直接向我咨询，我将结合案件的具体情况，为你提供更详细的法律分析和建议。