关于借款合同无效后诉讼时效如何计算的问题，这确实是一个涉及法律细节和权益保护的重要方面。以下是我为您详细梳理的解答：
一、借款合同无效对诉讼时效的基本影响
当借款合同被认定为无效时，其法律后果是合同自始不具有法律效力，即合同从未成立或生效。然而，这并不意味着与合同相关的所有法律问题都随之消失，特别是关于诉讼时效的问题。诉讼时效的起算和计算，通常与合同是否有效无直接关系，而是与权利人知道或应当知道其权利受到损害以及义务人之日起有关。
二、诉讼时效的起算时间
合同无效确认后：
- 若借款合同因法定事由（如欺诈、胁迫、违反法律强制性规定等）被确认无效，诉讼时效通常从合同被确认无效之日起算。这是因为，在合同被确认无效之前，权利人可能并不知晓其权利已受到损害。
特殊情况下的起算点：
- 如果合同无效的原因在合同签订时即已存在，且权利人应当知道或已经知道合同无效的事实，那么诉讼时效可能从合同签订时或权利人知道合同无效时起算。但这需要具体案件具体分析，因为“应当知道”是一个主观判断标准，需结合案件事实和证据来确定。
三、诉讼时效的中断与中止
诉讼时效中断：
- 在诉讼时效期间内，若权利人向义务人提出履行请求、义务人同意履行义务、权利人提起诉讼或申请仲裁等，诉讼时效将中断并重新计算。这一规定同样适用于借款合同无效后的诉讼时效计算。
诉讼时效中止：
- 若在诉讼时效期间的最后六个月内发生不可抗力或其他法定事由，导致权利人无法行使请求权，诉讼时效将中止。待中止事由消除后，诉讼时效期间继续计算。
四、实际案例与操作建议
实际案例：
- 假设甲与乙签订了一份借款合同，后因合同违反法律强制性规定被确认无效。甲在合同被确认无效后一年内发现乙因合同无效而获得了不当利益，甲此时提起诉讼要求乙返还不当利益，其诉讼时效应从合同被确认无效之日起算三年（假设无其他中断或中止情形）。
操作建议：
- 对于权利人而言，在借款合同被确认无效后，应及时了解自己的权利状况，并在诉讼时效期间内积极行使权利。
- 若发现义务人因合同无效而获得了不当利益，应及时向义务人提出返还请求，并保留好相关证据。
- 若诉讼时效期间即将届满，可考虑通过提起诉讼或申请仲裁等方式来中断诉讼时效，以维护自己的合法权益。
五、总结
借款合同无效后的诉讼时效计算是一个复杂而细致的问题，需要结合具体案件事实和法律规定来综合判断。作为权利人，应及时了解自己的权利状况，并在诉讼时效期间内积极行使权利，以确保自己的合法权益不受损害。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时咨询专业律师。