核心结论：监理采用框架协议不能直接办理施工许可证时，可通过补充正式监理合同、调整协议内容使其符合法定要求、或通过合法程序变更监理单位等方式解决。以下是具体分析：

1. 补充正式监理合同
   框架协议通常仅约定合作框架、计价方式等原则性条款，而施工许可证办理需提交正式监理合同（明确监理范围、期限、费用、双方权利义务等具体内容）。若框架协议未涵盖这些要素，可与监理单位签订补充协议或正式合同，确保合同内容符合《建设工程质量管理条例》第12条对监理合同的要求。

2. 调整框架协议内容
   若框架协议已具备监理合同核心条款（如监理范围、人员配置、服务期限等），可向当地住建部门申请确认其效力。部分地区允许通过补充说明文件（如框架协议与项目对应关系说明、监理计划等）完善申请材料，但需提前与主管部门沟通确认具体要求。

3. 变更监理单位（极端情况）
   若框架协议因主体资质、签署程序等问题无法补正（如监理单位未取得相应资质、协议未加盖公章等），需依法重新招标或直接委托具备资质的监理单位，并签订新合同后重新申请施工许可证。

操作建议：

• 优先与当地住建部门沟通，明确施工许可证申请材料中监理合同的具体要求（如是否必须为独立合同、是否接受框架协议+补充文件形式）；
  
• 若需补充合同，注意约定与框架协议的衔接条款（如费用结算、违约责任等），避免冲突；
  
• 监理单位资质需符合《工程监理企业资质管理规定》，否则即使签订合同也无法通过审批。

法律依据：

• 《建筑工程施工许可管理办法》第4条：申请施工许可证需提交“已经确定建筑施工企业的文件”及“有保证工程质量和安全的具体措施”（含监理合同）；
  
• 《建设工程质量管理条例》第12条：实行监理的建设工程，建设单位应当委托具有相应资质等级的工程监理单位进行监理，并签订书面监理合同。
  

如有进一步细节（如框架协议具体条款、当地政策差异等），可提供更多信息以便针对性分析。