结论：在签完离婚协议后发现小三怀孕，能否上诉追究，需分情况讨论。若离婚协议已生效且未涉及出轨相关赔偿或过错认定，一般难以直接通过上诉追究出轨责任；但若存在法定撤销事由或离婚协议存在重大误解、显失公平等情形，可依法主张撤销或变更离婚协议，并可能追究出轨方的相关责任。以下为详细分析：
一、离婚协议的法律效力
离婚协议是双方就离婚、子女抚养、财产分割等事项达成的合意，一旦签订并办理离婚登记手续，即具有法律效力。若离婚协议已经生效，且其中未涉及出轨赔偿或过错认定等条款，那么仅凭小三怀孕这一事实，一般难以直接通过上诉来追究出轨方的责任。因为离婚协议的签订，通常意味着双方已经就离婚相关事宜达成了共识，且该共识不违反法律法规的强制性规定。
二、可能存在的法律救济途径
尽管离婚协议已经生效，但在某些特定情况下，仍可能存在法律救济的途径：
撤销离婚协议：
- 法定撤销事由：根据《民法典》的相关规定，如果离婚协议存在欺诈、胁迫等情形，受损害方有权请求人民法院撤销该协议。若能证明出轨方在签订离婚协议时隐瞒了小三怀孕的事实，且该事实对离婚协议的签订产生了重大影响，那么可能构成欺诈，从而有权请求撤销离婚协议。
- 重大误解或显失公平：如果因出轨方隐瞒小三怀孕的事实，导致受损害方对离婚协议的内容产生了重大误解，或者离婚协议的内容显失公平，那么受损害方也有权请求人民法院撤销或变更该协议。
追究出轨方的损害赔偿责任：
- 离婚后损害赔偿请求权：根据《民法典》的相关规定，如果出轨方的行为构成重婚或者与他人同居等过错情形，且导致离婚的，无过错方有权请求损害赔偿。然而，这一请求权通常需要在离婚时或离婚后一定期限内提出，且需要提供充分的证据证明出轨方的过错行为。
- 证据收集：尽管你提到之前找不到出轨证据，但现在发现小三怀孕，这可能成为新的证据线索。你可以尝试收集与出轨方和小三相关的通信记录、照片、视频等证据，以证明出轨方的过错行为。
三、实际操作建议
- 咨询专业律师：由于法律问题具有复杂性和专业性，建议你咨询专业律师以获取更具体的法律建议。律师可以根据你的具体情况，分析离婚协议的效力、可能存在的法律救济途径以及证据收集等方面的问题。
- 收集证据：如果决定追究出轨方的责任，需要积极收集相关证据。这包括与出轨方和小三的通信记录、照片、视频等，以及可能存在的证人证言等。
- 考虑诉讼策略：在提起诉讼前，需要仔细考虑诉讼策略。这包括确定诉讼请求、选择适当的法律依据、准备充分的证据材料等。
四、注意事项
- 时效性：如果决定追究出轨方的损害赔偿责任，需要注意时效性问题。根据《民法典》的相关规定，离婚后损害赔偿请求权的行使期限可能受到一定限制。
- 证据的真实性：在收集证据时，需要确保证据的真实性和合法性。虚假证据不仅无法支持你的诉讼请求，还可能导致你承担法律责任。
最后，我理解你现在可能感到非常困惑和愤怒，但请保持冷静和理性。法律问题需要依法处理，建议你尽快咨询专业律师以获取更具体的法律建议和支持。如果你有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。